12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3700 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3700  initiator RepB protein  100 
 
 
403 aa  772    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000306619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3867  hypothetical protein  39.01 
 
 
415 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219578  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0953  hypothetical protein  29.98 
 
 
429 aa  178  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166964  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0567  initiator RepB protein  29.77 
 
 
389 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000593958  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3324  hypothetical protein  32.42 
 
 
393 aa  96.7  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.709661  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3349  initiator RepB protein  26.78 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3334  hypothetical protein  28.62 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2492  initiator RepB protein  36.96 
 
 
365 aa  60.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0217136  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  38.81 
 
 
320 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0671  hypothetical protein  28.84 
 
 
355 aa  50.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  25.61 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  23.53 
 
 
381 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>