12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0567 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0567  initiator RepB protein  100 
 
 
389 aa  746    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000593958  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3324  hypothetical protein  45.93 
 
 
393 aa  305  6e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.709661  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3349  initiator RepB protein  31.09 
 
 
398 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0953  hypothetical protein  29.38 
 
 
429 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166964  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3700  initiator RepB protein  31.23 
 
 
403 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000306619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3867  hypothetical protein  29 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219578  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1460  initiator RepB protein  29.85 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.805225  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3334  hypothetical protein  26.65 
 
 
369 aa  59.7  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2492  initiator RepB protein  34.12 
 
 
365 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0217136  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  21.16 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0671  hypothetical protein  26.83 
 
 
355 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  25.28 
 
 
320 aa  43.1  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>