13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3349 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3349  initiator RepB protein  100 
 
 		 398 aa  772    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3324  hypothetical protein  31.41 
 
 		 393 aa  153  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.709661  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0567  initiator RepB protein  31.09 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000593958  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0953  hypothetical protein  25.69 
 
 		 429 aa  100  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166964  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1460  initiator RepB protein  28.86 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.805225  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3700  initiator RepB protein  27.75 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000306619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3334  hypothetical protein  27.69 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3867  hypothetical protein  27.71 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219578  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0671  hypothetical protein  33.96 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2492  initiator RepB protein  30.48 
 
 		 365 aa  59.7  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0217136  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  24.11 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  24.65 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  31.4 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>