13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3324 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3324  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  759    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.709661  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0567  initiator RepB protein  45.93 
 
 
389 aa  305  6e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000593958  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3349  initiator RepB protein  31.41 
 
 
398 aa  153  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3700  initiator RepB protein  32.42 
 
 
403 aa  96.7  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000306619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3867  hypothetical protein  28.09 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219578  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0953  hypothetical protein  30.26 
 
 
429 aa  69.7  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166964  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3334  hypothetical protein  32.28 
 
 
369 aa  64.3  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  26.06 
 
 
320 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1460  initiator RepB protein  28.77 
 
 
384 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.805225  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  23.11 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2492  initiator RepB protein  24.76 
 
 
365 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0217136  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  26.53 
 
 
219 aa  43.9  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  26.47 
 
 
230 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>