12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2492 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2492  initiator RepB protein  100 
 
 		 365 aa  699    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3700  initiator RepB protein  36.03 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000306619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3349  initiator RepB protein  30.48 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0953  hypothetical protein  27.31 
 
 		 429 aa  62.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166964  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1460  initiator RepB protein  26.63 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.805225  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3867  hypothetical protein  33.14 
 
 		 415 aa  57  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219578  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0567  initiator RepB protein  35.8 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000593958  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  20.82 
 
 		 440 aa  53.5  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3324  hypothetical protein  24.76 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.709661  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3334  hypothetical protein  33.68 
 
 		 369 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  33.33 
 
 		 323 aa  43.5  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0671  hypothetical protein  26.09 
 
 		 355 aa  43.1  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>