15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5276 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5276  initiator RepB protein  100 
 
 		 371 aa  753    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5034  initiator RepB protein  30.83 
 
 		 340 aa  113  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3552  initiator RepB protein  30.46 
 
 		 223 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132106  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  29.29 
 
 		 320 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0004  hypothetical protein  26.11 
 
 		 429 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.18508  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7205  initiator RepB protein  30.77 
 
 		 433 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849181  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  24.89 
 
 		 404 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  30.65 
 
 		 315 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  23.21 
 
 		 399 aa  50.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6107  putative replication protein  22.98 
 
 		 457 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0069  plasmid replication initiation protein  24.1 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0037  initiator RepB protein  24.62 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3788  initiator RepB protein  24.44 
 
 		 440 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.593501  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A10  replication initiator protein  28.85 
 
 		 296 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00000639536  n/a   
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7066  initiator RepB protein  23.29 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>