213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2231 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2231  AAA ATPase  100 
 
 		 927 aa  1877    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.692531  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  36.26 
 
 		 271 aa  141  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  33.7 
 
 		 372 aa  135  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  32.27 
 
 		 392 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  31.87 
 
 		 395 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  30.45 
 
 		 302 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0884  AAA ATPase  31.62 
 
 		 318 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  32.58 
 
 		 563 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  33.33 
 
 		 372 aa  132  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  28.68 
 
 		 393 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  29.89 
 
 		 318 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.09 
 
 		 562 aa  130  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  31.07 
 
 		 390 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  30.5 
 
 		 296 aa  128  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  29.33 
 
 		 498 aa  128  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  30.51 
 
 		 281 aa  127  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  30.6 
 
 		 388 aa  127  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  31.44 
 
 		 320 aa  127  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  32.57 
 
 		 266 aa  126  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.69 
 
 		 536 aa  126  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  30.19 
 
 		 584 aa  126  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.46 
 
 		 562 aa  125  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  32.18 
 
 		 266 aa  125  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  31.48 
 
 		 540 aa  125  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  31.95 
 
 		 310 aa  124  6e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  29.66 
 
 		 538 aa  124  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  31.58 
 
 		 309 aa  124  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  31.58 
 
 		 309 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  30.65 
 
 		 267 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.62 
 
 		 577 aa  123  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.62 
 
 		 580 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  28.46 
 
 		 388 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  27.89 
 
 		 554 aa  121  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  32.71 
 
 		 308 aa  121  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  29.63 
 
 		 300 aa  121  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  30.57 
 
 		 563 aa  120  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  28.22 
 
 		 346 aa  120  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  30.37 
 
 		 387 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.47 
 
 		 572 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  31.6 
 
 		 303 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  29.15 
 
 		 357 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.43 
 
 		 562 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.24 
 
 		 562 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  30.35 
 
 		 422 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.18 
 
 		 613 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  31.58 
 
 		 310 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  30.34 
 
 		 314 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.18 
 
 		 562 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.18 
 
 		 558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  30.83 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  32.71 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  31.42 
 
 		 267 aa  118  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  32.45 
 
 		 275 aa  118  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  28.57 
 
 		 385 aa  118  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  29.37 
 
 		 368 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.42 
 
 		 557 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  32.71 
 
 		 302 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.42 
 
 		 557 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.46 
 
 		 562 aa  117  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  32.71 
 
 		 302 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.42 
 
 		 557 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  32.71 
 
 		 302 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  28.31 
 
 		 459 aa  117  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.42 
 
 		 557 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.33 
 
 		 532 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.8 
 
 		 559 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.84 
 
 		 568 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  30.48 
 
 		 549 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  32.71 
 
 		 300 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 564 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  30.38 
 
 		 439 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  26.9 
 
 		 505 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  28.9 
 
 		 541 aa  115  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  29.06 
 
 		 563 aa  115  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.39 
 
 		 587 aa  115  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  30.71 
 
 		 529 aa  114  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  30.38 
 
 		 301 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  27.21 
 
 		 358 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  28.84 
 
 		 266 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  30.63 
 
 		 519 aa  112  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.28 
 
 		 557 aa  112  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  30.13 
 
 		 532 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.42 
 
 		 541 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  29.96 
 
 		 354 aa  112  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  29.6 
 
 		 395 aa  112  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  29.21 
 
 		 291 aa  111  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.04 
 
 		 538 aa  111  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1030  general secretion pathway protein A  27.08 
 
 		 320 aa  111  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00881191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  30.61 
 
 		 302 aa  111  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.75 
 
 		 589 aa  110  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  27.82 
 
 		 338 aa  110  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  30.86 
 
 		 427 aa  110  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  29.21 
 
 		 291 aa  110  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  29.5 
 
 		 266 aa  110  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.84 
 
 		 556 aa  110  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  28.09 
 
 		 341 aa  109  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  28.21 
 
 		 281 aa  107  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  27.04 
 
 		 334 aa  107  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  31.11 
 
 		 570 aa  107  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  29.37 
 
 		 831 aa  105  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>