64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2756 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2756  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 386 aa  808    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.196216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4122  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  65.53 
 
 		 382 aa  527  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379517  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3486  extracellular solute-binding protein family 1  52.12 
 
 		 377 aa  402  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2273  hypothetical protein  50.66 
 
 		 395 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4991  hypothetical protein  40.53 
 
 		 376 aa  275  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  hitchhiker  0.00320461 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0306  hypothetical protein  41.11 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8225  extracellular solute-binding protein family 1  36.13 
 
 		 394 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108055  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5747  putative integral membrane protein  32.89 
 
 		 383 aa  213  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3589  hypothetical protein  34.14 
 
 		 352 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2495  hypothetical protein  31.14 
 
 		 368 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 421 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3588  hypothetical protein  46.81 
 
 		 75 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0553868 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  22.39 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  21.64 
 
 		 425 aa  53.1  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 422 aa  52.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1865  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 454 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 429 aa  50.4  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1047  extracellular solute-binding protein  32.98 
 
 		 433 aa  50.4  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1617  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 460 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0986  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.265801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 425 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  22.61 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  20.77 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  21.05 
 
 		 431 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  32.61 
 
 		 466 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2194  extracellular solute-binding protein  20.07 
 
 		 414 aa  46.6  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00903267  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  29.1 
 
 		 441 aa  46.2  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.57 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2274  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 1012 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  22.94 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  19.25 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  27.34 
 
 		 442 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0503  extracellular solute-binding protein  21.71 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000478191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 442 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  27.34 
 
 		 442 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  27.34 
 
 		 442 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  27.34 
 
 		 442 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  27.34 
 
 		 442 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  27.34 
 
 		 442 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  28.97 
 
 		 422 aa  43.9  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 363 aa  44.3  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03697  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.48 
 
 		 675 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  28.97 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 447 aa  43.5  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 418 aa  43.5  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  21.85 
 
 		 419 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  32.98 
 
 		 435 aa  43.1  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  32.18 
 
 		 435 aa  43.5  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 444 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  32.26 
 
 		 424 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  27.27 
 
 		 441 aa  43.1  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  21.53 
 
 		 440 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  19.88 
 
 		 412 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>