30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3486 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3486  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 377 aa  781    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2756  extracellular solute-binding protein family 1  52.12 
 
 		 386 aa  402  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.196216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4122  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  48.79 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2273  hypothetical protein  43.62 
 
 		 395 aa  349  4e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0306  hypothetical protein  38.07 
 
 		 374 aa  252  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4991  hypothetical protein  35.19 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  hitchhiker  0.00320461 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8225  extracellular solute-binding protein family 1  32.13 
 
 		 394 aa  206  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108055  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5747  putative integral membrane protein  30.4 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2495  hypothetical protein  27.03 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3589  hypothetical protein  28.36 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3588  hypothetical protein  56.25 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0553868 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2194  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00903267  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  22.05 
 
 		 436 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  21.89 
 
 		 431 aa  53.1  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  20.92 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  27.5 
 
 		 440 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  21.41 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  21.01 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  21.19 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  21.01 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  22.13 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 419 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  21.19 
 
 		 496 aa  46.2  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 453 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  21.19 
 
 		 446 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  37.1 
 
 		 432 aa  43.1  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 397 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>