55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4122 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4122  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 382 aa  795    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379517  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2756  extracellular solute-binding protein family 1  65.53 
 
 		 386 aa  527  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.196216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3486  extracellular solute-binding protein family 1  48.79 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2273  hypothetical protein  47.72 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4991  hypothetical protein  40.58 
 
 		 376 aa  279  7e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  hitchhiker  0.00320461 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0306  hypothetical protein  38.67 
 
 		 374 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8225  extracellular solute-binding protein family 1  33.59 
 
 		 394 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3589  hypothetical protein  33.33 
 
 		 352 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5747  putative integral membrane protein  31.56 
 
 		 383 aa  189  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2495  hypothetical protein  30.46 
 
 		 368 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3588  hypothetical protein  47.83 
 
 		 75 aa  53.5  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0553868 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  22.74 
 
 		 419 aa  53.1  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  20.71 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 		 411 aa  49.7  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  30.23 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  19.89 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.26 
 
 		 443 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.46 
 
 		 440 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  28.91 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.46 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2643  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 441 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0222782  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  28.91 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2511  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 441 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464819  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  28.91 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  28.91 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0702  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.812706  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  28.91 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  28.91 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 444 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  28.12 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2144  sugar-binding periplasmic signal peptide protein  27.54 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000125903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  21.1 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  28.26 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1047  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 433 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  30.2 
 
 		 425 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2041  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 436 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  21.28 
 
 		 431 aa  43.5  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 421 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0483  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 458 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 435 aa  43.1  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  21.1 
 
 		 424 aa  43.1  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0700  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  25.81 
 
 		 458 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>