28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2273 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2273  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  809    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2756  extracellular solute-binding protein family 1  50.66 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.196216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4122  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  47.72 
 
 		 382 aa  376  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379517  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3486  extracellular solute-binding protein family 1  43.62 
 
 		 377 aa  349  5e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4991  hypothetical protein  40.26 
 
 		 376 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  hitchhiker  0.00320461 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0306  hypothetical protein  40.11 
 
 		 374 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8225  extracellular solute-binding protein family 1  37.05 
 
 		 394 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108055  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5747  putative integral membrane protein  34.38 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2495  hypothetical protein  34.76 
 
 		 368 aa  180  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3589  hypothetical protein  38.44 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 423 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3588  hypothetical protein  45.83 
 
 		 75 aa  53.1  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0553868 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 421 aa  50.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.53 
 
 		 421 aa  49.7  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2194  extracellular solute-binding protein  20 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00903267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  26.43 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  31.18 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  22.14 
 
 		 414 aa  43.9  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 436 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  30.11 
 
 		 452 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  21.74 
 
 		 443 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1047  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 433 aa  42.7  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>