15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5747 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5747  putative integral membrane protein  100 
 
 		 383 aa  781    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0306  hypothetical protein  40.05 
 
 		 374 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4991  hypothetical protein  38.77 
 
 		 376 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  hitchhiker  0.00320461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2756  extracellular solute-binding protein family 1  32.89 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.196216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3486  extracellular solute-binding protein family 1  30.4 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4122  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.56 
 
 		 382 aa  197  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379517  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8225  extracellular solute-binding protein family 1  35.73 
 
 		 394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2273  hypothetical protein  34.38 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2495  hypothetical protein  35.23 
 
 		 368 aa  182  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3589  hypothetical protein  34.21 
 
 		 352 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 412 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>