17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4991 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4991  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  773    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  hitchhiker  0.00320461 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0306  hypothetical protein  66.4 
 
 		 374 aa  496  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4122  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  40.58 
 
 		 382 aa  279  6e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379517  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2756  extracellular solute-binding protein family 1  40.53 
 
 		 386 aa  275  9e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.196216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2273  hypothetical protein  40.26 
 
 		 395 aa  248  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3486  extracellular solute-binding protein family 1  35.19 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5747  putative integral membrane protein  38.77 
 
 		 383 aa  232  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2495  hypothetical protein  37.27 
 
 		 368 aa  213  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8225  extracellular solute-binding protein family 1  37.47 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3589  hypothetical protein  39.56 
 
 		 352 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3588  hypothetical protein  54.17 
 
 		 75 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0553868 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  23.06 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.8 
 
 		 402 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  23.03 
 
 		 437 aa  46.6  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  20.61 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>