39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0306 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0306  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  773    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4991  hypothetical protein  67.2 
 
 
376 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  hitchhiker  0.00320461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2756  extracellular solute-binding protein family 1  41.11 
 
 
386 aa  277  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.196216  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4122  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  38.67 
 
 
382 aa  268  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379517  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3486  extracellular solute-binding protein family 1  38.07 
 
 
377 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2273  hypothetical protein  40.11 
 
 
395 aa  255  9e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5747  putative integral membrane protein  39.78 
 
 
383 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514564  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8225  extracellular solute-binding protein family 1  35.84 
 
 
394 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108055  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2495  hypothetical protein  35.6 
 
 
368 aa  209  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3589  hypothetical protein  39.4 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 
437 aa  63.2  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 
420 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3588  hypothetical protein  54.17 
 
 
75 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0553868 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  22.26 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 
419 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 
435 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  25.09 
 
 
422 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 
433 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  23.8 
 
 
436 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  20.23 
 
 
428 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  35.14 
 
 
430 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.13 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 
437 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0940  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.29 
 
 
409 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69507  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  20.24 
 
 
425 aa  47  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 
452 aa  46.2  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  19.82 
 
 
434 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 
484 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  26.7 
 
 
468 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 
437 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  21.24 
 
 
428 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 
421 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
419 aa  43.9  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.24 
 
 
418 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 
423 aa  43.5  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 
421 aa  43.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 
424 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 
429 aa  42.7  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>