37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3589 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3589  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  710    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4991  hypothetical protein  39.56 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  hitchhiker  0.00320461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4122  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  33.33 
 
 		 382 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379517  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0306  hypothetical protein  39.1 
 
 		 374 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2756  extracellular solute-binding protein family 1  34.14 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.196216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2273  hypothetical protein  38.44 
 
 		 395 aa  179  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8225  extracellular solute-binding protein family 1  35.86 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108055  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2495  hypothetical protein  36.92 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5747  putative integral membrane protein  34.21 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3486  extracellular solute-binding protein family 1  28.36 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  21.57 
 
 		 440 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 439 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 439 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 484 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 420 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 446 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.34 
 
 		 496 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.67 
 
 		 418 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 410 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 		 414 aa  46.2  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 410 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 423 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.09 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 421 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 419 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  21.35 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  22.96 
 
 		 438 aa  43.1  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 430 aa  43.5  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 		 411 aa  43.5  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 452 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 431 aa  42.7  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 418 aa  42.7  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>