21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8225 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8225  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 394 aa  794    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108055  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2756  extracellular solute-binding protein family 1  36.13 
 
 		 386 aa  260  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.196216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4122  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  33.59 
 
 		 382 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2273  hypothetical protein  37.05 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4991  hypothetical protein  37.47 
 
 		 376 aa  229  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  hitchhiker  0.00320461 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3486  extracellular solute-binding protein family 1  32.13 
 
 		 377 aa  225  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0306  hypothetical protein  35.84 
 
 		 374 aa  219  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5747  putative integral membrane protein  35.73 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.514564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3589  hypothetical protein  35.86 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0617372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2495  hypothetical protein  33.07 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 		 440 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 363 aa  47.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.17 
 
 		 418 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1047  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  20.93 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3588  hypothetical protein  46.81 
 
 		 75 aa  43.5  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0553868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  20.53 
 
 		 434 aa  43.1  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>