More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1486 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
473 aa  961    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.43 
 
 
500 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.15 
 
 
470 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.71 
 
 
470 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.28 
 
 
470 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.88 
 
 
474 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.86 
 
 
465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.22 
 
 
469 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  45.13 
 
 
497 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.4 
 
 
466 aa  362  9e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.76 
 
 
455 aa  345  7e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
482 aa  334  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.09 
 
 
479 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.25 
 
 
466 aa  334  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.51 
 
 
489 aa  332  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
490 aa  329  7e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.57 
 
 
469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.45 
 
 
464 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.67 
 
 
484 aa  322  7e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.94 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.97 
 
 
488 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.54 
 
 
487 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.24 
 
 
511 aa  317  2e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.54 
 
 
487 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.54 
 
 
487 aa  317  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.45 
 
 
464 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.58 
 
 
481 aa  316  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.46 
 
 
483 aa  316  6e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.21 
 
 
458 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.81 
 
 
480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.62 
 
 
511 aa  314  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.58 
 
 
479 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.94 
 
 
474 aa  306  6e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.92 
 
 
460 aa  300  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.66 
 
 
462 aa  300  3e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.92 
 
 
460 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.46 
 
 
489 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.41 
 
 
456 aa  293  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 
484 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.33 
 
 
515 aa  280  3e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.55 
 
 
461 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  32.62 
 
 
475 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.75 
 
 
479 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.54 
 
 
479 aa  173  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.08 
 
 
480 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.29 
 
 
480 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.57 
 
 
479 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  30.9 
 
 
720 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.33 
 
 
479 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  33.48 
 
 
745 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.89 
 
 
489 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.88 
 
 
459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.85 
 
 
474 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1530  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.18 
 
 
480 aa  163  7e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.411134  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.56 
 
 
482 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.96 
 
 
480 aa  162  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13451  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.56 
 
 
481 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0908915  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1363  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.77 
 
 
448 aa  161  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.5 
 
 
456 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.3 
 
 
479 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.18 
 
 
473 aa  160  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.85 
 
 
482 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  31.56 
 
 
767 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  28.6 
 
 
546 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.22 
 
 
459 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.62 
 
 
460 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  27.35 
 
 
458 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  30.28 
 
 
704 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2105  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  31.17 
 
 
448 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0584847  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.56 
 
 
482 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.66 
 
 
475 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.15 
 
 
478 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.01 
 
 
487 aa  156  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  27.69 
 
 
461 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.18 
 
 
470 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0247  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.6 
 
 
478 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0691299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  30.39 
 
 
767 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.79 
 
 
454 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  30.3 
 
 
478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.36 
 
 
473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.11 
 
 
462 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.66 
 
 
484 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.02 
 
 
463 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.74 
 
 
482 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.18 
 
 
481 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0113  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.16 
 
 
480 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.51 
 
 
478 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.5 
 
 
470 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.43 
 
 
464 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.37 
 
 
459 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.18 
 
 
466 aa  152  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.14 
 
 
486 aa  151  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.19 
 
 
475 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.7 
 
 
478 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.87 
 
 
484 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.26 
 
 
473 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.68 
 
 
462 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.7 
 
 
478 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.39 
 
 
481 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  28.16 
 
 
453 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>