More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4888 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  80.17 
 
 		 466 aa  724    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 480 aa  964    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.47 
 
 		 464 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.35 
 
 		 482 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.53 
 
 		 484 aa  592  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.3 
 
 		 488 aa  585  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.63 
 
 		 487 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.63 
 
 		 487 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.89 
 
 		 490 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.1 
 
 		 490 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.42 
 
 		 487 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.91 
 
 		 469 aa  565  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.5 
 
 		 489 aa  558  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  58 
 
 		 489 aa  556  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.66 
 
 		 483 aa  552  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.99 
 
 		 464 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.96 
 
 		 479 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.25 
 
 		 484 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.02 
 
 		 462 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.25 
 
 		 479 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.96 
 
 		 481 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.49 
 
 		 474 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.49 
 
 		 456 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.98 
 
 		 511 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.06 
 
 		 460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.26 
 
 		 460 aa  354  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.12 
 
 		 470 aa  353  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.28 
 
 		 470 aa  351  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.72 
 
 		 515 aa  348  1e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.7 
 
 		 465 aa  347  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.74 
 
 		 511 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.76 
 
 		 470 aa  339  8e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.81 
 
 		 473 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.94 
 
 		 474 aa  332  9e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  41.12 
 
 		 497 aa  331  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.31 
 
 		 500 aa  330  3e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.59 
 
 		 469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.73 
 
 		 461 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.78 
 
 		 466 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.15 
 
 		 458 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.68 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  31 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.61 
 
 		 492 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.61 
 
 		 470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.4 
 
 		 473 aa  174  5e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.33 
 
 		 491 aa  173  6.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.69 
 
 		 463 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.5 
 
 		 456 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  31.74 
 
 		 550 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.9 
 
 		 475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.21 
 
 		 616 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  31.28 
 
 		 767 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.79 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  28.91 
 
 		 466 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.69 
 
 		 475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  27.59 
 
 		 468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  31.34 
 
 		 767 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.73 
 
 		 451 aa  164  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.76 
 
 		 467 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.37 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.48 
 
 		 468 aa  160  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  28.69 
 
 		 479 aa  160  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.7 
 
 		 473 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.3 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.67 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  30.18 
 
 		 475 aa  158  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.82 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.82 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.45 
 
 		 478 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.85 
 
 		 464 aa  158  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2746  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.58 
 
 		 462 aa  158  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.23613  normal  0.0266411 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  29.19 
 
 		 455 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.45 
 
 		 478 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.12 
 
 		 468 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.73 
 
 		 465 aa  156  6e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0740  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.68 
 
 		 469 aa  156  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.03 
 
 		 593 aa  156  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.16 
 
 		 469 aa  156  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.05 
 
 		 467 aa  156  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.12 
 
 		 468 aa  156  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  29.27 
 
 		 590 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.03 
 
 		 470 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  32.39 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  29.37 
 
 		 459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.57 
 
 		 487 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.33 
 
 		 478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.43 
 
 		 482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  29.37 
 
 		 459 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.19 
 
 		 495 aa  154  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.74 
 
 		 482 aa  154  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.89 
 
 		 480 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.15 
 
 		 478 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.57 
 
 		 539 aa  153  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26614  predicted protein  27.49 
 
 		 504 aa  153  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261513  normal  0.318168 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.19 
 
 		 464 aa  153  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  29.51 
 
 		 745 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  29 
 
 		 459 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  30.4 
 
 		 459 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.94 
 
 		 472 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  31.86 
 
 		 476 aa  153  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>