More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0826 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 489 aa  1005    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.74 
 
 		 487 aa  570  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.74 
 
 		 487 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.45 
 
 		 489 aa  570  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.74 
 
 		 487 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.3 
 
 		 482 aa  566  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.49 
 
 		 490 aa  565  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.53 
 
 		 488 aa  563  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.81 
 
 		 484 aa  561  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.86 
 
 		 490 aa  558  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.62 
 
 		 483 aa  546  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.51 
 
 		 484 aa  545  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.03 
 
 		 479 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.11 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  58 
 
 		 480 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.32 
 
 		 464 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.85 
 
 		 464 aa  488  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.82 
 
 		 469 aa  488  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.91 
 
 		 479 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.46 
 
 		 474 aa  462  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 		 462 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.79 
 
 		 481 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.75 
 
 		 515 aa  368  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.44 
 
 		 511 aa  356  5e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.52 
 
 		 470 aa  353  5e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.23 
 
 		 456 aa  350  4e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.04 
 
 		 460 aa  349  7e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.21 
 
 		 470 aa  349  7e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.41 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.88 
 
 		 511 aa  347  3e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.66 
 
 		 470 aa  347  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.51 
 
 		 473 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 		 469 aa  327  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.58 
 
 		 461 aa  326  6e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.33 
 
 		 474 aa  320  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.89 
 
 		 500 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.9 
 
 		 465 aa  317  4e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  38.6 
 
 		 497 aa  309  8e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.9 
 
 		 455 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.18 
 
 		 458 aa  273  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.7 
 
 		 466 aa  271  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.87 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.63 
 
 		 475 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.18 
 
 		 467 aa  180  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.28 
 
 		 456 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.21 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2746  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.75 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.23613  normal  0.0266411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.72 
 
 		 473 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  30.63 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.72 
 
 		 470 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.78 
 
 		 470 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.41 
 
 		 466 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  29.55 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  29.07 
 
 		 546 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  28.63 
 
 		 546 aa  171  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.48 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.22 
 
 		 470 aa  170  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.08 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.75 
 
 		 463 aa  167  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.47 
 
 		 459 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  26.92 
 
 		 461 aa  167  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.72 
 
 		 459 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.11 
 
 		 467 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  29.79 
 
 		 455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.9 
 
 		 472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.05 
 
 		 473 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.42 
 
 		 480 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.27 
 
 		 473 aa  164  4.0000000000000004e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.82 
 
 		 459 aa  163  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  30.56 
 
 		 500 aa  163  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.26 
 
 		 467 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.61 
 
 		 459 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.98 
 
 		 463 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.44 
 
 		 470 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.84 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  28.84 
 
 		 717 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.78 
 
 		 475 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.82 
 
 		 459 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.39 
 
 		 459 aa  160  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.82 
 
 		 459 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  28.84 
 
 		 467 aa  160  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.38 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  28.21 
 
 		 479 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  28.45 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.11 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3549  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.54 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.48 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.06 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.05 
 
 		 478 aa  158  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.95 
 
 		 468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.71 
 
 		 459 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.08 
 
 		 491 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1692  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  27.78 
 
 		 464 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215126 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.4 
 
 		 470 aa  156  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.29 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2169  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  28.4 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.4 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.39 
 
 		 459 aa  156  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.4 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.4 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>