More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1352 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
455 aa  915    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.91 
 
 
458 aa  734    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.2 
 
 
465 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.76 
 
 
473 aa  345  7e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.44 
 
 
466 aa  332  8e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  41.15 
 
 
497 aa  323  4e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.73 
 
 
500 aa  322  6e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.4 
 
 
469 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.69 
 
 
470 aa  311  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.62 
 
 
479 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.77 
 
 
470 aa  300  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.77 
 
 
470 aa  299  7e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 
474 aa  297  3e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.3 
 
 
479 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.2 
 
 
489 aa  290  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.97 
 
 
484 aa  288  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.87 
 
 
482 aa  286  5e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.9 
 
 
489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.92 
 
 
487 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.92 
 
 
487 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.92 
 
 
487 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.46 
 
 
490 aa  282  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.08 
 
 
490 aa  279  7e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.31 
 
 
474 aa  279  7e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.65 
 
 
469 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.61 
 
 
488 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.28 
 
 
460 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.28 
 
 
460 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.48 
 
 
464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.63 
 
 
464 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.42 
 
 
462 aa  265  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.65 
 
 
466 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.62 
 
 
481 aa  259  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.61 
 
 
456 aa  258  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.68 
 
 
480 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.36 
 
 
484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.32 
 
 
483 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.18 
 
 
511 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 
511 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.34 
 
 
461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.01 
 
 
515 aa  228  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.48 
 
 
470 aa  172  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.28 
 
 
473 aa  160  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.58 
 
 
482 aa  159  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.7 
 
 
462 aa  156  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  32.19 
 
 
546 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  33.6 
 
 
546 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.1 
 
 
616 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.01 
 
 
464 aa  150  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.19 
 
 
470 aa  150  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.42 
 
 
482 aa  150  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.02 
 
 
482 aa  150  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.25 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.08 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  31.37 
 
 
546 aa  147  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.23 
 
 
470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  31.37 
 
 
546 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.23 
 
 
470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.23 
 
 
470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.23 
 
 
470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.23 
 
 
470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.23 
 
 
470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.23 
 
 
470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.23 
 
 
470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.23 
 
 
470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  30.37 
 
 
550 aa  147  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.12 
 
 
468 aa  147  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.12 
 
 
468 aa  147  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.12 
 
 
468 aa  146  9e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.24 
 
 
456 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.81 
 
 
475 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  29.85 
 
 
767 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.48 
 
 
480 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.81 
 
 
464 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0084  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.31 
 
 
473 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.62 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.19 
 
 
475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.15 
 
 
464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.56 
 
 
475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  31.12 
 
 
475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.76 
 
 
470 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.97 
 
 
475 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.48 
 
 
479 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3460  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.69 
 
 
458 aa  139  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13451  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.39 
 
 
481 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0908915  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.03 
 
 
459 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.95 
 
 
465 aa  139  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.93 
 
 
468 aa  138  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2829  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.66 
 
 
464 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3549  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.88 
 
 
468 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.92 
 
 
473 aa  138  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.51 
 
 
462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.17 
 
 
472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35490  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.06 
 
 
464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730291 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.57 
 
 
479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.73 
 
 
462 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.04 
 
 
462 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.93 
 
 
462 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.27 
 
 
489 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  29.05 
 
 
448 aa  137  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>