More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2075 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
500 aa  1007    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.12 
 
 
470 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.12 
 
 
470 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.78 
 
 
470 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.75 
 
 
474 aa  501  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.43 
 
 
473 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.34 
 
 
465 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  50.11 
 
 
497 aa  432  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.43 
 
 
469 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.37 
 
 
466 aa  364  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.33 
 
 
490 aa  361  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.87 
 
 
488 aa  359  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.57 
 
 
482 aa  358  9e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.17 
 
 
484 aa  358  9e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.31 
 
 
490 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.3 
 
 
487 aa  355  6.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.3 
 
 
487 aa  355  6.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.09 
 
 
487 aa  354  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.01 
 
 
479 aa  352  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.83 
 
 
474 aa  346  4e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.1 
 
 
466 aa  346  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.48 
 
 
464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.6 
 
 
464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.39 
 
 
483 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.11 
 
 
489 aa  335  9e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.83 
 
 
455 aa  333  5e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.8 
 
 
481 aa  330  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.78 
 
 
489 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.89 
 
 
484 aa  326  5e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.39 
 
 
469 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.2 
 
 
462 aa  320  5e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.31 
 
 
480 aa  320  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.53 
 
 
479 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.14 
 
 
511 aa  313  5.999999999999999e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.83 
 
 
515 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.18 
 
 
511 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.98 
 
 
456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.71 
 
 
458 aa  300  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.74 
 
 
460 aa  295  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.96 
 
 
460 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.67 
 
 
461 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  31.81 
 
 
767 aa  190  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  32.17 
 
 
767 aa  186  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  32.39 
 
 
745 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  31.13 
 
 
479 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
482 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.3 
 
 
482 aa  179  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  32.02 
 
 
720 aa  178  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  31.41 
 
 
475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.74 
 
 
473 aa  173  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.2 
 
 
459 aa  172  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.4 
 
 
475 aa  170  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.45 
 
 
479 aa  170  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.4 
 
 
478 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.4 
 
 
478 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2746  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.09 
 
 
462 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.23613  normal  0.0266411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.47 
 
 
472 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.15 
 
 
480 aa  167  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2607  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.57 
 
 
474 aa  167  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.59 
 
 
456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  28.42 
 
 
546 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.15 
 
 
480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.21 
 
 
461 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  30.53 
 
 
507 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.69 
 
 
472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  30.95 
 
 
457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.42 
 
 
470 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1363  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.89 
 
 
448 aa  163  7e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.98 
 
 
494 aa  163  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  30.56 
 
 
479 aa  163  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.02 
 
 
465 aa  163  8.000000000000001e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.6 
 
 
471 aa  163  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.13 
 
 
475 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.23 
 
 
473 aa  162  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.41 
 
 
467 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.02 
 
 
464 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.13 
 
 
475 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.99 
 
 
478 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  30.46 
 
 
704 aa  160  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  30.77 
 
 
546 aa  160  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.54 
 
 
467 aa  159  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.66 
 
 
463 aa  159  8e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.95 
 
 
476 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.75 
 
 
467 aa  159  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.48 
 
 
474 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.18 
 
 
468 aa  159  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  30.87 
 
 
548 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.54 
 
 
467 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.18 
 
 
464 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.13 
 
 
467 aa  159  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.69 
 
 
463 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.04 
 
 
462 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.64 
 
 
467 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.57 
 
 
478 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  28.7 
 
 
510 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.76 
 
 
468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.95 
 
 
476 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.67 
 
 
462 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.63 
 
 
463 aa  156  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.33 
 
 
467 aa  156  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>