More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2433 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.11 
 
 		 470 aa  707    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 470 aa  935    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.32 
 
 		 470 aa  709    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.78 
 
 		 500 aa  556  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.36 
 
 		 474 aa  551  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  51.26 
 
 		 497 aa  461  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.15 
 
 		 473 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  50 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.11 
 
 		 469 aa  403  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.52 
 
 		 489 aa  353  5e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.41 
 
 		 490 aa  349  5e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.2 
 
 		 466 aa  346  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.74 
 
 		 484 aa  344  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.07 
 
 		 487 aa  342  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.07 
 
 		 487 aa  342  9e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.07 
 
 		 487 aa  342  9e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.12 
 
 		 479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 		 490 aa  338  9e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.27 
 
 		 482 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.89 
 
 		 488 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.07 
 
 		 481 aa  331  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.13 
 
 		 464 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 511 aa  323  3e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 		 483 aa  324  3e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.53 
 
 		 511 aa  323  4e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.96 
 
 		 462 aa  322  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.23 
 
 		 474 aa  317  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.01 
 
 		 466 aa  317  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 		 464 aa  316  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.76 
 
 		 480 aa  315  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.36 
 
 		 479 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.56 
 
 		 469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.68 
 
 		 484 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.69 
 
 		 455 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.55 
 
 		 489 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.61 
 
 		 460 aa  296  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.83 
 
 		 460 aa  296  7e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.11 
 
 		 456 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.87 
 
 		 515 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.8 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.81 
 
 		 461 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.65 
 
 		 459 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.3 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.3 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.58 
 
 		 482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  32.83 
 
 		 767 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.77 
 
 		 477 aa  163  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  29.27 
 
 		 455 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  32.92 
 
 		 745 aa  162  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.68 
 
 		 456 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.94 
 
 		 478 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.96 
 
 		 478 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.22 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.72 
 
 		 478 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.18 
 
 		 482 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.51 
 
 		 478 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  28.32 
 
 		 461 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.72 
 
 		 478 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.92 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.54 
 
 		 480 aa  160  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.32 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  29.32 
 
 		 478 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  30.82 
 
 		 767 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.66 
 
 		 478 aa  156  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.83 
 
 		 473 aa  156  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.61 
 
 		 462 aa  156  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  27.61 
 
 		 507 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  27.78 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0265  mycothione reductase  30.24 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  29.28 
 
 		 546 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1765  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.14 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187504  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.67 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  32.61 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.82 
 
 		 462 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  35.85 
 
 		 557 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.6 
 
 		 462 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.55 
 
 		 479 aa  150  6e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.49 
 
 		 475 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.27 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.6 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  30.52 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.06 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  30 
 
 		 720 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.7 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3549  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.06 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.78 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.62 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  30.04 
 
 		 459 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  27.8 
 
 		 461 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.55 
 
 		 479 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.78 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.49 
 
 		 475 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.84 
 
 		 459 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.13 
 
 		 479 aa  146  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  28.79 
 
 		 704 aa  146  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.35 
 
 		 459 aa  146  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.72 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  27.41 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  26.37 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.27 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>