More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0768 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 511 aa  1053    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  89.82 
 
 		 511 aa  956    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.58 
 
 		 515 aa  544  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.88 
 
 		 489 aa  347  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.21 
 
 		 482 aa  339  8e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.38 
 
 		 479 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.74 
 
 		 487 aa  333  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.74 
 
 		 487 aa  333  6e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.74 
 
 		 487 aa  333  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.37 
 
 		 484 aa  332  9e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.78 
 
 		 479 aa  332  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.68 
 
 		 490 aa  327  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.68 
 
 		 490 aa  325  9e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.53 
 
 		 470 aa  323  5e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  37.5 
 
 		 497 aa  319  6e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.58 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.24 
 
 		 473 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.25 
 
 		 488 aa  316  7e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.45 
 
 		 483 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.08 
 
 		 469 aa  313  5.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.38 
 
 		 489 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.49 
 
 		 470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.74 
 
 		 480 aa  307  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.77 
 
 		 470 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.25 
 
 		 481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.35 
 
 		 474 aa  303  5.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.11 
 
 		 484 aa  300  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.76 
 
 		 474 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.81 
 
 		 500 aa  294  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 		 464 aa  293  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.74 
 
 		 464 aa  279  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.34 
 
 		 460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.92 
 
 		 460 aa  274  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.73 
 
 		 462 aa  272  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.9 
 
 		 465 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.01 
 
 		 469 aa  269  7e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.31 
 
 		 456 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.77 
 
 		 461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 		 455 aa  240  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.76 
 
 		 466 aa  240  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.42 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.51 
 
 		 467 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.64 
 
 		 467 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.48 
 
 		 465 aa  171  2e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.42 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.81 
 
 		 581 aa  167  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.19 
 
 		 458 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.57 
 
 		 492 aa  167  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3460  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.76 
 
 		 458 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.03 
 
 		 463 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.33 
 
 		 471 aa  163  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.99 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.99 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.05 
 
 		 462 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.21 
 
 		 463 aa  160  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.24 
 
 		 465 aa  160  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  29.81 
 
 		 507 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.11 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.91 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  28.7 
 
 		 550 aa  158  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.12 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.75 
 
 		 616 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.08 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.99 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.7 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.18 
 
 		 459 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.13 
 
 		 491 aa  154  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.72 
 
 		 462 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.47 
 
 		 458 aa  153  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  29.09 
 
 		 704 aa  153  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.86 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.87 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.95 
 
 		 466 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.21 
 
 		 462 aa  152  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0235  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.27 
 
 		 466 aa  151  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.03 
 
 		 459 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  28.99 
 
 		 510 aa  151  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.6 
 
 		 459 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.56 
 
 		 475 aa  150  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0709  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.96 
 
 		 476 aa  150  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26614  predicted protein  28.48 
 
 		 504 aa  150  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261513  normal  0.318168 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.67 
 
 		 468 aa  150  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.83 
 
 		 467 aa  150  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.45 
 
 		 467 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.45 
 
 		 462 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.82 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.72 
 
 		 562 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.99 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.17 
 
 		 464 aa  149  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.16 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00663567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.01 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  28.57 
 
 		 466 aa  148  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.35 
 
 		 467 aa  148  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1363  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.75 
 
 		 448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.12 
 
 		 467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.33 
 
 		 459 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.91 
 
 		 462 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.28 
 
 		 457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.69 
 
 		 459 aa  147  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>