More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0240 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  100 
 
 		 497 aa  993    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.26 
 
 		 470 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.69 
 
 		 465 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.58 
 
 		 470 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.58 
 
 		 470 aa  428  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.28 
 
 		 474 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.13 
 
 		 473 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.37 
 
 		 469 aa  378  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.38 
 
 		 466 aa  350  4e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.77 
 
 		 490 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.29 
 
 		 484 aa  333  4e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.58 
 
 		 466 aa  330  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.14 
 
 		 488 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.79 
 
 		 479 aa  327  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.59 
 
 		 490 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.74 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.15 
 
 		 455 aa  323  5e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 482 aa  320  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.52 
 
 		 511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.5 
 
 		 511 aa  319  6e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.72 
 
 		 460 aa  319  7e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.19 
 
 		 460 aa  318  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.54 
 
 		 479 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.67 
 
 		 487 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.67 
 
 		 487 aa  316  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.67 
 
 		 487 aa  316  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.84 
 
 		 469 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.12 
 
 		 480 aa  310  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.31 
 
 		 456 aa  310  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  42 
 
 		 464 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.6 
 
 		 489 aa  309  8e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.49 
 
 		 481 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.92 
 
 		 483 aa  302  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 		 462 aa  297  3e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.74 
 
 		 474 aa  297  3e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 		 458 aa  296  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.12 
 
 		 489 aa  294  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.34 
 
 		 484 aa  292  9e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.81 
 
 		 515 aa  283  6.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.67 
 
 		 461 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.79 
 
 		 459 aa  186  9e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.7 
 
 		 459 aa  170  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.57 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.71 
 
 		 464 aa  167  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.48 
 
 		 473 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.85 
 
 		 680 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.56 
 
 		 482 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  28.36 
 
 		 546 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2607  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.09 
 
 		 474 aa  163  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0433  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.42 
 
 		 475 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.54 
 
 		 482 aa  161  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.05 
 
 		 484 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.34 
 
 		 470 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.45 
 
 		 468 aa  160  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3911  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.66 
 
 		 475 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000450783  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.84 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.24 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.93 
 
 		 470 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.41 
 
 		 619 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  28.72 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  27.64 
 
 		 546 aa  158  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.44 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.44 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.44 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  27.64 
 
 		 546 aa  157  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.44 
 
 		 470 aa  158  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4052  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.45 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00676379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.44 
 
 		 470 aa  158  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.44 
 
 		 470 aa  158  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.42 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3932  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.45 
 
 		 475 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000133391  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.75 
 
 		 469 aa  157  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.42 
 
 		 482 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.42 
 
 		 463 aa  157  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  29.75 
 
 		 457 aa  157  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.63 
 
 		 468 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4805  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.88 
 
 		 477 aa  156  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.98 
 
 		 478 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.71 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.42 
 
 		 484 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.48 
 
 		 478 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.79 
 
 		 475 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.42 
 
 		 625 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.98 
 
 		 478 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.44 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3854  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.25 
 
 		 475 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.075768  hitchhiker  0.000000345632 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.44 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.98 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.44 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0421  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.02 
 
 		 475 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000187748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1334  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  28.18 
 
 		 452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.106224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2746  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.1 
 
 		 462 aa  154  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.23613  normal  0.0266411 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.08 
 
 		 459 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.34 
 
 		 478 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  28.16 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0321  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.22 
 
 		 476 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0683294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.13 
 
 		 478 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.39 
 
 		 599 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3775  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.91 
 
 		 476 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>