More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3471 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 483 aa  1000    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.3 
 
 		 487 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.42 
 
 		 488 aa  711    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.3 
 
 		 487 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.77 
 
 		 482 aa  667    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.36 
 
 		 484 aa  702    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.71 
 
 		 490 aa  687    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.12 
 
 		 490 aa  692    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.3 
 
 		 487 aa  660    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.56 
 
 		 489 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.62 
 
 		 489 aa  561  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.64 
 
 		 479 aa  561  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.78 
 
 		 466 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.49 
 
 		 484 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.66 
 
 		 480 aa  522  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.72 
 
 		 464 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.65 
 
 		 479 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.22 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.96 
 
 		 462 aa  463  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.41 
 
 		 474 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.14 
 
 		 481 aa  455  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 515 aa  343  4e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 		 511 aa  342  5.999999999999999e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 		 470 aa  341  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.89 
 
 		 470 aa  338  9e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.31 
 
 		 470 aa  333  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.45 
 
 		 511 aa  332  1e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.39 
 
 		 500 aa  330  3e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.01 
 
 		 456 aa  329  8e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.46 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.72 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.28 
 
 		 460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.06 
 
 		 460 aa  318  9e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  38.92 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.36 
 
 		 465 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.53 
 
 		 474 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.61 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.32 
 
 		 455 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 		 466 aa  252  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.68 
 
 		 458 aa  249  9e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.6 
 
 		 475 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.21 
 
 		 475 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.46 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.13 
 
 		 465 aa  177  3e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  29.15 
 
 		 468 aa  175  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.53 
 
 		 473 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  30.15 
 
 		 767 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.15 
 
 		 472 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.72 
 
 		 463 aa  172  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.98 
 
 		 487 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.53 
 
 		 459 aa  172  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.49 
 
 		 482 aa  169  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.78 
 
 		 539 aa  169  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.43 
 
 		 487 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.12 
 
 		 481 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  28.99 
 
 		 479 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.57 
 
 		 479 aa  166  6.9999999999999995e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.23 
 
 		 479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.63 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.46 
 
 		 464 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.78 
 
 		 468 aa  164  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2746  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.98 
 
 		 462 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.23613  normal  0.0266411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.79 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  30.67 
 
 		 475 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.54 
 
 		 470 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  29.12 
 
 		 466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.83 
 
 		 480 aa  163  8.000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  28.18 
 
 		 516 aa  162  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.7 
 
 		 473 aa  162  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.5 
 
 		 489 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.09 
 
 		 465 aa  162  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.94 
 
 		 494 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  29.13 
 
 		 767 aa  161  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  29.06 
 
 		 479 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.66 
 
 		 479 aa  161  3e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.23 
 
 		 479 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.66 
 
 		 480 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.78 
 
 		 482 aa  160  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.66 
 
 		 479 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.82 
 
 		 464 aa  160  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.39 
 
 		 461 aa  160  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.17 
 
 		 470 aa  160  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.12 
 
 		 456 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.5 
 
 		 481 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.49 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.99 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1530  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.79 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.411134  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.66 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  28.07 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.09 
 
 		 459 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.62 
 
 		 459 aa  158  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.09 
 
 		 459 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.07 
 
 		 470 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.48 
 
 		 458 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.32 
 
 		 476 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.69 
 
 		 478 aa  156  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  29.09 
 
 		 584 aa  157  6e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5041  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.48 
 
 		 477 aa  156  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.1 
 
 		 473 aa  156  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>