More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3949 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
464 aa  922    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.81 
 
 
464 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.3 
 
 
466 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.99 
 
 
480 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.25 
 
 
484 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.55 
 
 
490 aa  512  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.76 
 
 
490 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.48 
 
 
487 aa  511  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.48 
 
 
487 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.48 
 
 
487 aa  510  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.35 
 
 
488 aa  510  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.32 
 
 
489 aa  504  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.58 
 
 
482 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.57 
 
 
489 aa  491  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.14 
 
 
479 aa  478  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.22 
 
 
483 aa  478  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.88 
 
 
484 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.58 
 
 
469 aa  461  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.87 
 
 
462 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.92 
 
 
479 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.53 
 
 
481 aa  432  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.09 
 
 
474 aa  413  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.35 
 
 
460 aa  375  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.35 
 
 
460 aa  375  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.93 
 
 
456 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  41.82 
 
 
497 aa  338  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.6 
 
 
500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.45 
 
 
473 aa  327  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 
470 aa  325  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.4 
 
 
470 aa  323  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.26 
 
 
469 aa  323  4e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.62 
 
 
470 aa  323  6e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.21 
 
 
511 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.25 
 
 
515 aa  316  6e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.92 
 
 
461 aa  315  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.86 
 
 
474 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 
465 aa  309  6.999999999999999e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.74 
 
 
511 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.56 
 
 
455 aa  270  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.39 
 
 
458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.71 
 
 
466 aa  260  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2746  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.16 
 
 
462 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.23613  normal  0.0266411 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  29.42 
 
 
466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.11 
 
 
468 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  29.26 
 
 
461 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  29 
 
 
459 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.02 
 
 
470 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.91 
 
 
470 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.9 
 
 
482 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.69 
 
 
482 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.84 
 
 
467 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.92 
 
 
475 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05900  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.59 
 
 
477 aa  152  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.257436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  30.42 
 
 
767 aa  152  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.87 
 
 
475 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.12 
 
 
459 aa  150  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.56 
 
 
459 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.44 
 
 
456 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.15 
 
 
467 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.94 
 
 
467 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  32.1 
 
 
767 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.27 
 
 
476 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.48 
 
 
472 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.91 
 
 
616 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.98 
 
 
466 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16069  predicted protein  29.33 
 
 
532 aa  145  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258027  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.33 
 
 
473 aa  145  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.23 
 
 
459 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.98 
 
 
466 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.98 
 
 
466 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.6 
 
 
459 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.44 
 
 
469 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.73 
 
 
470 aa  144  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.57 
 
 
462 aa  144  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  27.6 
 
 
468 aa  143  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  30.57 
 
 
745 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.1 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.94 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  30.22 
 
 
461 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.01 
 
 
466 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.7 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.87 
 
 
474 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  28.91 
 
 
479 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5145  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.98 
 
 
466 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.671755  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.18 
 
 
468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.39 
 
 
459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.28 
 
 
475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.79 
 
 
459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.51 
 
 
465 aa  141  3e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.33 
 
 
454 aa  141  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.75 
 
 
473 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.65 
 
 
476 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.55 
 
 
474 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0996  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.1 
 
 
478 aa  140  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137288  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.24 
 
 
467 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.96 
 
 
459 aa  140  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.53 
 
 
480 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.9 
 
 
471 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.33 
 
 
473 aa  138  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.96 
 
 
458 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>