More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1974 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 479 aa  968    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.03 
 
 		 490 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.42 
 
 		 490 aa  531  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.88 
 
 		 484 aa  526  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.4 
 
 		 488 aa  520  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.26 
 
 		 489 aa  521  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.3 
 
 		 487 aa  504  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.3 
 
 		 487 aa  504  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.51 
 
 		 487 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.24 
 
 		 482 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.61 
 
 		 479 aa  489  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.91 
 
 		 489 aa  487  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.65 
 
 		 483 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.1 
 
 		 466 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.3 
 
 		 481 aa  473  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.36 
 
 		 474 aa  458  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.27 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.69 
 
 		 484 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.25 
 
 		 480 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.66 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.68 
 
 		 462 aa  424  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.92 
 
 		 464 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 		 511 aa  351  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.23 
 
 		 515 aa  350  5e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.38 
 
 		 511 aa  335  1e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.83 
 
 		 469 aa  335  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.61 
 
 		 465 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.83 
 
 		 456 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.44 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.02 
 
 		 460 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  40.54 
 
 		 497 aa  318  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.26 
 
 		 474 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.36 
 
 		 470 aa  315  8e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.36 
 
 		 470 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.15 
 
 		 470 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.58 
 
 		 473 aa  307  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.53 
 
 		 500 aa  303  7.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.3 
 
 		 455 aa  292  9e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.7 
 
 		 461 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.75 
 
 		 458 aa  279  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.04 
 
 		 466 aa  266  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.45 
 
 		 459 aa  179  7e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2746  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.36 
 
 		 462 aa  179  9e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.23613  normal  0.0266411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  29.7 
 
 		 461 aa  170  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.48 
 
 		 459 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  29.11 
 
 		 546 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  31.84 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.7 
 
 		 459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  30.77 
 
 		 745 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  30.2 
 
 		 475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.12 
 
 		 468 aa  163  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  30 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  30.21 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.4 
 
 		 462 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.72 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  29.63 
 
 		 466 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.62 
 
 		 478 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.62 
 
 		 478 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  31.34 
 
 		 560 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.36 
 
 		 456 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.24 
 
 		 467 aa  159  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.71 
 
 		 463 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.27 
 
 		 462 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  28.45 
 
 		 704 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.99 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.24 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2798  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.9 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5793  normal  0.535486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  31.4 
 
 		 767 aa  159  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  30.94 
 
 		 714 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  28.83 
 
 		 469 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  29.55 
 
 		 767 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  30.47 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.01 
 
 		 468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.94 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0235  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.35 
 
 		 466 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.75 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.85 
 
 		 459 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  26.75 
 
 		 546 aa  155  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.79 
 
 		 475 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.51 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  28.73 
 
 		 459 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  28.73 
 
 		 459 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.33 
 
 		 462 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  28.73 
 
 		 459 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  26.75 
 
 		 546 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.79 
 
 		 475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  30.67 
 
 		 714 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.42 
 
 		 462 aa  154  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.03 
 
 		 468 aa  153  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3977  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.91 
 
 		 481 aa  153  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.69 
 
 		 474 aa  153  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.96 
 
 		 495 aa  152  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.57 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.42 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  32.06 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08580  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  29.2 
 
 		 467 aa  152  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.745964 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  29.78 
 
 		 562 aa  152  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  28.21 
 
 		 479 aa  152  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.9 
 
 		 478 aa  151  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.57 
 
 		 467 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>