More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1491 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 469 aa  957    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.77 
 
 		 465 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.69 
 
 		 470 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.69 
 
 		 470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.11 
 
 		 470 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.22 
 
 		 473 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.43 
 
 		 500 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  42.37 
 
 		 497 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.72 
 
 		 466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.62 
 
 		 474 aa  352  8e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.65 
 
 		 479 aa  352  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.7 
 
 		 466 aa  336  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.83 
 
 		 479 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.43 
 
 		 490 aa  331  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.5 
 
 		 484 aa  330  4e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.98 
 
 		 489 aa  330  4e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 		 489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.22 
 
 		 490 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.58 
 
 		 482 aa  326  7e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.33 
 
 		 487 aa  323  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.33 
 
 		 487 aa  323  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.33 
 
 		 487 aa  323  6e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 		 469 aa  322  8e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.66 
 
 		 488 aa  322  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.4 
 
 		 455 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.81 
 
 		 481 aa  320  5e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.72 
 
 		 483 aa  312  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.5 
 
 		 458 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.35 
 
 		 462 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.26 
 
 		 464 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.59 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  39 
 
 		 464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.51 
 
 		 474 aa  302  8.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.14 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.72 
 
 		 460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.5 
 
 		 460 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.89 
 
 		 511 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.01 
 
 		 511 aa  269  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.19 
 
 		 456 aa  266  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.67 
 
 		 515 aa  260  4e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.15 
 
 		 461 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.9 
 
 		 470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.1 
 
 		 465 aa  167  5e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.06 
 
 		 464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  27.63 
 
 		 459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.67 
 
 		 470 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.29 
 
 		 459 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  29.14 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  30.95 
 
 		 546 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  26.34 
 
 		 455 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.34 
 
 		 482 aa  160  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.51 
 
 		 470 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.57 
 
 		 458 aa  156  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.6 
 
 		 616 aa  156  8e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.09 
 
 		 464 aa  156  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  26.55 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2607  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.82 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  26.33 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.48 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3775  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.77 
 
 		 476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.24 
 
 		 680 aa  153  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.81 
 
 		 602 aa  153  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.69 
 
 		 619 aa  153  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0430  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.54 
 
 		 475 aa  153  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.27 
 
 		 488 aa  153  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3911  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.71 
 
 		 475 aa  152  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000450783  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.98 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.98 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  27.13 
 
 		 507 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.91 
 
 		 470 aa  152  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.6 
 
 		 459 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3597  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.33 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000546829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.18 
 
 		 473 aa  151  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0428  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.33 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00251394  normal  0.166632 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.84 
 
 		 603 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0426  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.33 
 
 		 475 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4052  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.5 
 
 		 475 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00676379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3932  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.5 
 
 		 475 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000133391  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.98 
 
 		 625 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.19 
 
 		 515 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0433  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.25 
 
 		 475 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5878  mycothione reductase  27.53 
 
 		 460 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  26.91 
 
 		 516 aa  150  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.87 
 
 		 476 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.35 
 
 		 607 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.67 
 
 		 473 aa  150  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.16 
 
 		 478 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  25.76 
 
 		 459 aa  150  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.16 
 
 		 478 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.27 
 
 		 460 aa  150  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.86 
 
 		 472 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.97 
 
 		 468 aa  149  8e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0985  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.49 
 
 		 472 aa  149  8e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.66 
 
 		 476 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.61 
 
 		 456 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0377  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.27 
 
 		 476 aa  149  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349282 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.69 
 
 		 476 aa  149  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  30.31 
 
 		 546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  30.02 
 
 		 546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.66 
 
 		 492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>