More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1181 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
469 aa  942    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.78 
 
 
462 aa  589  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.63 
 
 
484 aa  534  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.67 
 
 
490 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.72 
 
 
489 aa  526  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.7 
 
 
487 aa  522  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.35 
 
 
466 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.7 
 
 
487 aa  521  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.3 
 
 
482 aa  519  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.7 
 
 
487 aa  521  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.47 
 
 
490 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.91 
 
 
480 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.58 
 
 
479 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.82 
 
 
488 aa  507  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.82 
 
 
489 aa  488  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.24 
 
 
464 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 
483 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.84 
 
 
474 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.64 
 
 
484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.27 
 
 
479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.58 
 
 
464 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.23 
 
 
481 aa  435  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.06 
 
 
456 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.2 
 
 
460 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.57 
 
 
460 aa  343  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.57 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.89 
 
 
470 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.33 
 
 
511 aa  324  2e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 
469 aa  322  8e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.02 
 
 
515 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.82 
 
 
470 aa  319  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.67 
 
 
461 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.9 
 
 
465 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  41.84 
 
 
497 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.56 
 
 
470 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.08 
 
 
511 aa  313  5.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.39 
 
 
500 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 
458 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.11 
 
 
474 aa  286  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.01 
 
 
466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.65 
 
 
455 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.96 
 
 
492 aa  186  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.09 
 
 
470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.09 
 
 
473 aa  183  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.5 
 
 
459 aa  182  8.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.83 
 
 
456 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.53 
 
 
470 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.14 
 
 
475 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.14 
 
 
475 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.32 
 
 
491 aa  178  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.88 
 
 
470 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.04 
 
 
464 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.26 
 
 
468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.04 
 
 
494 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2746  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.18 
 
 
462 aa  173  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.23613  normal  0.0266411 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.33 
 
 
473 aa  173  5.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  31.9 
 
 
475 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.84 
 
 
480 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0745  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.78 
 
 
461 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  31.29 
 
 
767 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.03 
 
 
463 aa  171  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.05 
 
 
451 aa  171  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.37 
 
 
474 aa  171  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  27.27 
 
 
460 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.19 
 
 
482 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.2 
 
 
470 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  32.17 
 
 
767 aa  170  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.42 
 
 
468 aa  170  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.42 
 
 
468 aa  170  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.33 
 
 
464 aa  169  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.89 
 
 
482 aa  169  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.02 
 
 
463 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.85 
 
 
460 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.51 
 
 
470 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.85 
 
 
464 aa  168  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1003  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.9 
 
 
594 aa  167  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.851611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.55 
 
 
470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  31.89 
 
 
745 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.55 
 
 
470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.55 
 
 
470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.55 
 
 
470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.55 
 
 
470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.55 
 
 
470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.01 
 
 
459 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0996  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.12 
 
 
478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137288  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.43 
 
 
472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.22 
 
 
466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  33.18 
 
 
550 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.55 
 
 
470 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.55 
 
 
470 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.55 
 
 
470 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00115  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.12 
 
 
474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3486  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.12 
 
 
474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0123  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.12 
 
 
495 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.83 
 
 
472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0120  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.12 
 
 
474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447957  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0118  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.12 
 
 
474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00709642  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0109  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.12 
 
 
474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.809196  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.12 
 
 
495 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3543  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.12 
 
 
474 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.399649  normal  0.262226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>