More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0121 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
474 aa  947    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.02 
 
 
489 aa  498  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.76 
 
 
490 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.17 
 
 
484 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.16 
 
 
488 aa  494  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.74 
 
 
490 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.84 
 
 
469 aa  477  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.93 
 
 
479 aa  478  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.46 
 
 
489 aa  474  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.13 
 
 
487 aa  472  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.33 
 
 
487 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.28 
 
 
482 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.33 
 
 
487 aa  473  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.36 
 
 
479 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.02 
 
 
481 aa  463  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.41 
 
 
483 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.35 
 
 
466 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.73 
 
 
484 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.95 
 
 
462 aa  433  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.49 
 
 
480 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.08 
 
 
464 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.09 
 
 
464 aa  412  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.83 
 
 
500 aa  343  5e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.11 
 
 
470 aa  331  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.83 
 
 
460 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.74 
 
 
470 aa  330  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.83 
 
 
460 aa  329  6e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.23 
 
 
470 aa  328  9e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.42 
 
 
465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.66 
 
 
511 aa  319  6e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.31 
 
 
515 aa  318  1e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.83 
 
 
474 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.35 
 
 
511 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.82 
 
 
456 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.94 
 
 
473 aa  312  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  41.6 
 
 
497 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.51 
 
 
469 aa  310  4e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.69 
 
 
461 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 
455 aa  299  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.27 
 
 
458 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.83 
 
 
466 aa  280  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.74 
 
 
475 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.53 
 
 
475 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2746  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.71 
 
 
462 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.23613  normal  0.0266411 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.24 
 
 
456 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.5 
 
 
473 aa  169  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.04 
 
 
472 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.04 
 
 
470 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.56 
 
 
480 aa  166  9e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.24 
 
 
463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.15 
 
 
473 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  32.16 
 
 
475 aa  162  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.93 
 
 
473 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.49 
 
 
473 aa  162  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.67 
 
 
473 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  31.74 
 
 
767 aa  160  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.37 
 
 
463 aa  159  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  29.19 
 
 
546 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.15 
 
 
472 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.07 
 
 
464 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.13 
 
 
470 aa  158  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.85 
 
 
470 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.25 
 
 
488 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0740  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.67 
 
 
469 aa  157  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010396  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.6 
 
 
468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.92 
 
 
459 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  32.32 
 
 
745 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.16 
 
 
464 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.13 
 
 
465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.65 
 
 
495 aa  154  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  32.35 
 
 
479 aa  154  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  31.09 
 
 
722 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.35 
 
 
482 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.16 
 
 
471 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  32.31 
 
 
560 aa  153  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  30.26 
 
 
550 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0113  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.8 
 
 
480 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335173  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.36 
 
 
459 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1363  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.91 
 
 
448 aa  152  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.23 
 
 
459 aa  152  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.94 
 
 
477 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.04 
 
 
479 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.78 
 
 
473 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  27.56 
 
 
516 aa  150  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.33 
 
 
473 aa  150  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  28.63 
 
 
459 aa  150  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.65 
 
 
487 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.73 
 
 
468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.25 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.73 
 
 
468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.37 
 
 
481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  30 
 
 
489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.46 
 
 
473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  32.32 
 
 
767 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.09 
 
 
484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  30.72 
 
 
548 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.91 
 
 
467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1530  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.65 
 
 
480 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.411134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.15 
 
 
470 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.65 
 
 
539 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>