More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3487 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
479 aa  971    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.26 
 
 
490 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.69 
 
 
489 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.85 
 
 
490 aa  558  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.14 
 
 
484 aa  552  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.66 
 
 
484 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.06 
 
 
488 aa  551  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.64 
 
 
483 aa  547  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.03 
 
 
489 aa  539  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.44 
 
 
487 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.44 
 
 
487 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.44 
 
 
487 aa  536  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.19 
 
 
482 aa  531  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.84 
 
 
466 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.58 
 
 
469 aa  507  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.61 
 
 
479 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.96 
 
 
480 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.93 
 
 
474 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.14 
 
 
464 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.58 
 
 
481 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.09 
 
 
464 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  50 
 
 
462 aa  443  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.82 
 
 
470 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.82 
 
 
470 aa  362  8e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.65 
 
 
469 aa  352  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.86 
 
 
460 aa  350  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.33 
 
 
456 aa  349  5e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.84 
 
 
515 aa  348  1e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.21 
 
 
511 aa  348  1e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.86 
 
 
460 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.83 
 
 
465 aa  342  7e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.12 
 
 
470 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 
500 aa  336  5.999999999999999e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.09 
 
 
473 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.78 
 
 
511 aa  332  1e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  40.79 
 
 
497 aa  327  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.62 
 
 
455 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
474 aa  310  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.75 
 
 
458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.94 
 
 
461 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.82 
 
 
466 aa  268  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.72 
 
 
470 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.85 
 
 
470 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.02 
 
 
470 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.36 
 
 
470 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.7 
 
 
459 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.76 
 
 
473 aa  180  4.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.07 
 
 
470 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.07 
 
 
470 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.07 
 
 
470 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.07 
 
 
470 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.07 
 
 
470 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.07 
 
 
470 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.07 
 
 
470 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.07 
 
 
470 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.07 
 
 
470 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.01 
 
 
468 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  30.24 
 
 
767 aa  177  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.98 
 
 
467 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.5 
 
 
475 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.5 
 
 
475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.79 
 
 
468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.79 
 
 
468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  31.62 
 
 
475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.47 
 
 
492 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.33 
 
 
473 aa  174  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  30.84 
 
 
767 aa  173  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  29.41 
 
 
479 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.43 
 
 
470 aa  171  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.87 
 
 
465 aa  170  5e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.38 
 
 
459 aa  170  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2746  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.7 
 
 
462 aa  169  9e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.23613  normal  0.0266411 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.86 
 
 
475 aa  169  9e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32 
 
 
482 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0740  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.74 
 
 
469 aa  167  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010396  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  32.11 
 
 
470 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.72 
 
 
459 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.72 
 
 
456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.79 
 
 
469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  28.6 
 
 
516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.15 
 
 
459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.7 
 
 
616 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.29 
 
 
482 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.03 
 
 
464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.38 
 
 
478 aa  163  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.31 
 
 
482 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.71 
 
 
458 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3549  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.33 
 
 
468 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  28.6 
 
 
515 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.18 
 
 
480 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.97 
 
 
467 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.78 
 
 
467 aa  159  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  29.09 
 
 
745 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.42 
 
 
484 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  31.7 
 
 
560 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.32 
 
 
459 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.57 
 
 
468 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.57 
 
 
467 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  31.6 
 
 
562 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.37 
 
 
585 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>