More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3245 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 466 aa  946    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.98 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.37 
 
 		 500 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.4 
 
 		 473 aa  365  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.72 
 
 		 469 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  39.38 
 
 		 497 aa  349  7e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.44 
 
 		 455 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.3 
 
 		 458 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.27 
 
 		 470 aa  325  9e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.27 
 
 		 470 aa  324  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.01 
 
 		 470 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.01 
 
 		 474 aa  313  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.22 
 
 		 466 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.52 
 
 		 456 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.72 
 
 		 460 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.44 
 
 		 460 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.06 
 
 		 481 aa  276  6e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.25 
 
 		 469 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.04 
 
 		 479 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.7 
 
 		 489 aa  274  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.83 
 
 		 474 aa  274  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.78 
 
 		 480 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.27 
 
 		 487 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.27 
 
 		 487 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.27 
 
 		 487 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.82 
 
 		 479 aa  270  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.68 
 
 		 490 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.34 
 
 		 490 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.19 
 
 		 482 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.73 
 
 		 484 aa  265  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.75 
 
 		 488 aa  263  4.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.03 
 
 		 464 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.68 
 
 		 489 aa  259  8e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.71 
 
 		 464 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 		 483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.53 
 
 		 462 aa  243  5e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.76 
 
 		 511 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.04 
 
 		 511 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 		 484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.57 
 
 		 461 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.74 
 
 		 515 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4760  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.77 
 
 		 462 aa  187  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  30.54 
 
 		 479 aa  176  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  31.82 
 
 		 745 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.72 
 
 		 464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  30.28 
 
 		 475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.84 
 
 		 470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  29.6 
 
 		 500 aa  173  5.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  29.45 
 
 		 767 aa  173  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.31 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.36 
 
 		 478 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.36 
 
 		 478 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.81 
 
 		 480 aa  167  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.36 
 
 		 464 aa  167  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.1 
 
 		 473 aa  166  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.4 
 
 		 491 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  28.16 
 
 		 455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.87 
 
 		 478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.7 
 
 		 470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.62 
 
 		 478 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.1 
 
 		 451 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  29.17 
 
 		 767 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.45 
 
 		 478 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.29 
 
 		 475 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2775  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.51 
 
 		 452 aa  163  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373811  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0459  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.48 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.24 
 
 		 478 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.26 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.07 
 
 		 475 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  28.18 
 
 		 546 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  27.98 
 
 		 507 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.94 
 
 		 475 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.03 
 
 		 478 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.68 
 
 		 465 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.03 
 
 		 478 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.11 
 
 		 480 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.45 
 
 		 477 aa  160  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0527  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.25 
 
 		 464 aa  160  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  27.41 
 
 		 478 aa  160  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  28.91 
 
 		 461 aa  160  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  30.02 
 
 		 720 aa  159  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.19 
 
 		 459 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.82 
 
 		 478 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0113  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.48 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335173  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  26.99 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3554  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.61 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.38 
 
 		 468 aa  157  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.33 
 
 		 463 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.17 
 
 		 479 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.09 
 
 		 473 aa  157  5.0000000000000005e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.49 
 
 		 465 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.51 
 
 		 473 aa  156  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.63 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.96 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  29.95 
 
 		 546 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  28.83 
 
 		 548 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.18 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2607  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.07 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.35 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.26 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>