More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2524 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
481 aa  946    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.31 
 
 
490 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.21 
 
 
488 aa  498  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.3 
 
 
479 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.69 
 
 
490 aa  487  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.04 
 
 
484 aa  484  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.24 
 
 
482 aa  480  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.13 
 
 
487 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.13 
 
 
487 aa  475  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.01 
 
 
487 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.58 
 
 
479 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.87 
 
 
489 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.02 
 
 
474 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.41 
 
 
466 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.14 
 
 
483 aa  457  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.79 
 
 
489 aa  451  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.23 
 
 
469 aa  449  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.89 
 
 
484 aa  435  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.92 
 
 
464 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.96 
 
 
480 aa  435  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.53 
 
 
464 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.16 
 
 
462 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  39 
 
 
515 aa  342  1e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.07 
 
 
470 aa  340  5e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.51 
 
 
470 aa  335  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.73 
 
 
470 aa  334  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.71 
 
 
511 aa  331  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.81 
 
 
469 aa  329  8e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.8 
 
 
500 aa  325  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.84 
 
 
465 aa  322  9.000000000000001e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.58 
 
 
473 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.31 
 
 
474 aa  322  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.25 
 
 
511 aa  316  5e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.18 
 
 
460 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  40.49 
 
 
497 aa  312  9e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.09 
 
 
460 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.1 
 
 
456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.71 
 
 
461 aa  289  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.06 
 
 
466 aa  272  8.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.26 
 
 
455 aa  262  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.29 
 
 
458 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.14 
 
 
475 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.26 
 
 
475 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.51 
 
 
463 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.82 
 
 
463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2746  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.41 
 
 
462 aa  163  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.23613  normal  0.0266411 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.37 
 
 
465 aa  162  1e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.11 
 
 
480 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.52 
 
 
487 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.6 
 
 
459 aa  160  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.49 
 
 
459 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.96 
 
 
593 aa  159  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3787  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  28.54 
 
 
468 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.99 
 
 
473 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.2 
 
 
467 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.77 
 
 
478 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.77 
 
 
478 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.3 
 
 
468 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.74 
 
 
450 aa  156  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.45 
 
 
478 aa  155  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.49 
 
 
482 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.64 
 
 
482 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.39 
 
 
473 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.79 
 
 
473 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.27 
 
 
482 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.33 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.48 
 
 
464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.5 
 
 
470 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  27 
 
 
473 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.54 
 
 
476 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.27 
 
 
464 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3002  pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  29 
 
 
473 aa  153  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.57 
 
 
599 aa  153  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.47 
 
 
487 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.82 
 
 
488 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.83 
 
 
482 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.47 
 
 
472 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4408  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  27.06 
 
 
466 aa  152  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0258323  normal  0.0356369 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0128  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  27.68 
 
 
468 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.964966  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.35 
 
 
476 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.04 
 
 
466 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.26 
 
 
625 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.47 
 
 
539 aa  151  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.02 
 
 
476 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.26 
 
 
486 aa  150  4e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.08 
 
 
477 aa  150  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1988  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.18 
 
 
475 aa  150  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.25 
 
 
457 aa  150  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.27 
 
 
459 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.96 
 
 
456 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.85 
 
 
472 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.24 
 
 
680 aa  150  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  26.68 
 
 
468 aa  150  7e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4774  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  27.82 
 
 
465 aa  150  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.125317  hitchhiker  0.00386206 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12870  mycothione reductase  30.06 
 
 
459 aa  150  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.135712  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.58 
 
 
562 aa  150  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09170  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  29.48 
 
 
475 aa  149  8e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.62 
 
 
481 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1783  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.79 
 
 
475 aa  149  9e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.12 
 
 
480 aa  149  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>