More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2712 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.98 
 
 		 487 aa  748    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 488 aa  1008    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.98 
 
 		 487 aa  748    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.45 
 
 		 484 aa  882    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.68 
 
 		 489 aa  634    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.15 
 
 		 482 aa  759    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.98 
 
 		 487 aa  748    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  84.9 
 
 		 490 aa  878    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.42 
 
 		 483 aa  697    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  88.78 
 
 		 490 aa  911    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.53 
 
 		 489 aa  563  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.61 
 
 		 484 aa  560  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.32 
 
 		 466 aa  557  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.06 
 
 		 479 aa  551  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.3 
 
 		 480 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.48 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.4 
 
 		 479 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.82 
 
 		 469 aa  507  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.35 
 
 		 464 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.21 
 
 		 481 aa  481  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.16 
 
 		 474 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.96 
 
 		 462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.87 
 
 		 500 aa  347  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.31 
 
 		 456 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.19 
 
 		 460 aa  340  5e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.63 
 
 		 470 aa  340  5e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.42 
 
 		 470 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.28 
 
 		 515 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.98 
 
 		 460 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.89 
 
 		 470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.89 
 
 		 511 aa  330  3e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  39.14 
 
 		 497 aa  328  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.1 
 
 		 465 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.66 
 
 		 469 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.97 
 
 		 473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.25 
 
 		 511 aa  316  7e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.57 
 
 		 474 aa  312  6.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.83 
 
 		 461 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.61 
 
 		 455 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.14 
 
 		 458 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.09 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.06 
 
 		 475 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.06 
 
 		 475 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.68 
 
 		 473 aa  173  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  29.53 
 
 		 767 aa  172  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.02 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.79 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  29.55 
 
 		 767 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  29.89 
 
 		 479 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.84 
 
 		 464 aa  163  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  30.11 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.26 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.69 
 
 		 585 aa  161  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  26.81 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.46 
 
 		 479 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.65 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  31.31 
 
 		 548 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.74 
 
 		 482 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.11 
 
 		 459 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2746  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.58 
 
 		 462 aa  156  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.23613  normal  0.0266411 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.48 
 
 		 456 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.26 
 
 		 479 aa  156  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.16 
 
 		 478 aa  156  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  30.33 
 
 		 516 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.05 
 
 		 475 aa  155  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.88 
 
 		 469 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  29.21 
 
 		 562 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.58 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  29.04 
 
 		 515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.38 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.63 
 
 		 460 aa  154  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.39 
 
 		 462 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0996  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.54 
 
 		 478 aa  154  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28 
 
 		 472 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  27.64 
 
 		 466 aa  153  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.19 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.02 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  27.99 
 
 		 459 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.25 
 
 		 468 aa  152  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.93 
 
 		 465 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.78 
 
 		 473 aa  151  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.98 
 
 		 467 aa  151  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_638  mercuric reductase-like protein  27.27 
 
 		 499 aa  151  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000028153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.66 
 
 		 459 aa  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.05 
 
 		 470 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.77 
 
 		 463 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.9 
 
 		 462 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.57 
 
 		 467 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.48 
 
 		 461 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.63 
 
 		 462 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.33 
 
 		 479 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.39 
 
 		 515 aa  150  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.86 
 
 		 471 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  27.99 
 
 		 745 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  27.41 
 
 		 461 aa  150  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.75 
 
 		 495 aa  149  8e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.1 
 
 		 465 aa  149  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.99 
 
 		 465 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1643  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.77 
 
 		 474 aa  149  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000472029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>