More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4777 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3471  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.77 
 
 		 483 aa  653    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.654288  normal  0.739502 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3889  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.47 
 
 		 487 aa  882    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.523756 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00037  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.85 
 
 		 490 aa  758    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0135  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.27 
 
 		 487 aa  881    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4777  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 482 aa  991    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411672 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2215  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.19 
 
 		 484 aa  766    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4081  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.47 
 
 		 487 aa  882    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.15 
 
 		 488 aa  759    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002318  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.6 
 
 		 490 aa  740    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1254  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.55 
 
 		 489 aa  611  9.999999999999999e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4451  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.83 
 
 		 466 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0826  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.3 
 
 		 489 aa  566  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4888  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.35 
 
 		 480 aa  544  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.226887  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5354  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.87 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3487  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.19 
 
 		 479 aa  531  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0181  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.8 
 
 		 484 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1181  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.3 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1714  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1974  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.24 
 
 		 479 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0645  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.53 
 
 		 462 aa  496  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3949  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.58 
 
 		 464 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2524  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.24 
 
 		 481 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.698329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0121  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.28 
 
 		 474 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0774  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.77 
 
 		 511 aa  351  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4448  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.42 
 
 		 460 aa  350  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1769  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.12 
 
 		 515 aa  348  1e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.42 
 
 		 460 aa  348  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.546306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.06 
 
 		 456 aa  345  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.198826  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2075  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.57 
 
 		 500 aa  343  4e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0140167  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.21 
 
 		 511 aa  339  7e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2433  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.27 
 
 		 470 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.284173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1629  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.07 
 
 		 470 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.361871  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 		 473 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2245  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.86 
 
 		 470 aa  333  3e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0145  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.35 
 
 		 465 aa  330  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.709282  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1491  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.58 
 
 		 469 aa  326  7e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0240  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  39.96 
 
 		 497 aa  320  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.91 
 
 		 474 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680162  normal  0.329313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3724  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.51 
 
 		 461 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.859961  normal  0.138612 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1352  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.87 
 
 		 455 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2398  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.91 
 
 		 458 aa  267  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000284917  hitchhiker  0.00000373105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3245  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.76 
 
 		 466 aa  261  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0114174  hitchhiker  0.00583811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  29.91 
 
 		 466 aa  177  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.82 
 
 		 475 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2746  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.39 
 
 		 462 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.23613  normal  0.0266411 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.18 
 
 		 475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.51 
 
 		 470 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.16 
 
 		 465 aa  171  4e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.51 
 
 		 464 aa  169  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.75 
 
 		 467 aa  167  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.09 
 
 		 463 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  28.08 
 
 		 468 aa  166  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.81 
 
 		 460 aa  166  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  29.75 
 
 		 479 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.51 
 
 		 463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.53 
 
 		 473 aa  163  5.0000000000000005e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.35 
 
 		 470 aa  163  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.24 
 
 		 466 aa  163  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.12 
 
 		 475 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.72 
 
 		 467 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.87 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.51 
 
 		 472 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.52 
 
 		 470 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  29.96 
 
 		 767 aa  159  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.69 
 
 		 450 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.4 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.25 
 
 		 482 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.61 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.84 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.06 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03223  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.57 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.416876  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.57 
 
 		 467 aa  158  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3911  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.37 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000450783  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.79 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  30.02 
 
 		 767 aa  158  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.47 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.56 
 
 		 482 aa  156  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  30.02 
 
 		 516 aa  156  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.66 
 
 		 462 aa  156  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3932  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.14 
 
 		 475 aa  156  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000133391  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.77 
 
 		 459 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.12 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.09 
 
 		 466 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4052  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.14 
 
 		 475 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00676379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.07 
 
 		 478 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.25 
 
 		 462 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  31.19 
 
 		 479 aa  155  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  30.13 
 
 		 560 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0996  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.49 
 
 		 478 aa  154  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.14 
 
 		 474 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.92 
 
 		 481 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  29.61 
 
 		 564 aa  153  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.38 
 
 		 473 aa  153  8e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.35 
 
 		 466 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0377  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.67 
 
 		 476 aa  153  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349282 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.86 
 
 		 480 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.35 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  29.6 
 
 		 745 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.35 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.04 
 
 		 459 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3415  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.21 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000233503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>