253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4406 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4406  chaperone CupC2  100 
 
 		 133 aa  273  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  55.22 
 
 		 237 aa  150  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  53.33 
 
 		 238 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  42.86 
 
 		 249 aa  110  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  42.86 
 
 		 246 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.09 
 
 		 247 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.09 
 
 		 247 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  44.96 
 
 		 248 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.91 
 
 		 248 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  42.19 
 
 		 248 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  38.46 
 
 		 256 aa  94  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  38.28 
 
 		 245 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  42.52 
 
 		 250 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  38.81 
 
 		 227 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3747  pili assembly chaperone  42.19 
 
 		 234 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.81685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  40.15 
 
 		 250 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  36.92 
 
 		 247 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  39.84 
 
 		 251 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  43.85 
 
 		 257 aa  87  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  38.93 
 
 		 244 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  36.92 
 
 		 246 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  37.21 
 
 		 241 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  41.54 
 
 		 248 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  39.23 
 
 		 234 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  35.29 
 
 		 241 aa  84  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  37.69 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.69 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  37.5 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  37.69 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  37.69 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  33.6 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  37.69 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  37.04 
 
 		 250 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  37.12 
 
 		 264 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  34.04 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.21 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  36.43 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  34.35 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  36.43 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  36.43 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  30.95 
 
 		 248 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  36.43 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  37.96 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  37.96 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  35.66 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.43 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3825  pili assembly chaperone  38.28 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  37.96 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  34.88 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  34.88 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  34.88 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  34.88 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  36.84 
 
 		 250 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.66 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.01 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  39.84 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  39.84 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  39.84 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  39.06 
 
 		 230 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  33.85 
 
 		 253 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1134  pili assembly chaperone  32.12 
 
 		 261 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  0.162532 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  39.06 
 
 		 237 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  33.85 
 
 		 253 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  37.01 
 
 		 252 aa  70.5  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.14 
 
 		 252 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  33.08 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.04 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  36.64 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.28 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  33.06 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1276  gram-negative pili assembly chaperone  33.33 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.315526 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.75 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  34.62 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  34.62 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  33.08 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  34.62 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  35.2 
 
 		 263 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  29.58 
 
 		 260 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  34.62 
 
 		 309 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  34.62 
 
 		 309 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  31.01 
 
 		 248 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  32.52 
 
 		 248 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  33.33 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  33.33 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  33.04 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  32.06 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  32.82 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  30.28 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0404  pili assembly chaperone  34.13 
 
 		 255 aa  62  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  35.94 
 
 		 230 aa  62  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2460  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  32 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  34.65 
 
 		 236 aa  62  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  33.33 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  34.92 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  33.09 
 
 		 249 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  33.33 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  34.92 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  34.13 
 
 		 272 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1317  fimbral chaperone protein  31.82 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  31.71 
 
 		 248 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>