194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2726 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  99.57 
 
 		 230 aa  470  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  47.53 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  47.53 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  47.53 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  47.53 
 
 		 230 aa  218  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  47.53 
 
 		 230 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  45.7 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  44.84 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  44.84 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  44.84 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  44.84 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  44.84 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  44.84 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  44.84 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  44.84 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  44.39 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  36 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  37.84 
 
 		 230 aa  168  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  38.84 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  40 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5467  protein of unknown function DUF421  34.38 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  37.17 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  37.17 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  31.98 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2486  hypothetical protein  34.78 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3116  protein of unknown function DUF421  30.04 
 
 		 229 aa  98.6  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0519  protein of unknown function DUF421  30.05 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5258  membrane protein-like protein  27.23 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5259  protein of unknown function DUF421  26.58 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0625  protein of unknown function DUF421  26.76 
 
 		 226 aa  88.6  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  30.67 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  27.13 
 
 		 172 aa  77.4  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  26.87 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0520  protein of unknown function DUF421  29.36 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0626  protein of unknown function DUF421  23.18 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0141494  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  25.93 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  26.71 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  29.41 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  25.16 
 
 		 172 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1059  protein of unknown function DUF421  23.23 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  25.52 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  25.16 
 
 		 211 aa  67  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  27.22 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  26.71 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  24.14 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  25.87 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  25.29 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  23.78 
 
 		 147 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  28.12 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  24.84 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  29.32 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  28.36 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  24.48 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  24.48 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  29.41 
 
 		 253 aa  61.6  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  31.65 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  24.46 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  28.29 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  26.06 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  25.64 
 
 		 170 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  23.78 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  26.45 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  28.89 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0218  protein of unknown function DUF421  26.72 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0485499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  27.74 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1758  hypothetical protein  22.73 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  24.1 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  27.45 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2411  hypothetical protein  22.82 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  27.82 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  27.74 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  26.57 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  25.58 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  26.57 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  23.91 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  25.31 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  30.3 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06995  hypothetical protein  27.7 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294218  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1869  membrane protein-like protein  26.87 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  24.14 
 
 		 149 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2188  hypothetical protein  25.56 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000216241  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  24.84 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3499  hypothetical protein  20.61 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.664218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  25.6 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  26.92 
 
 		 177 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  20.81 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  29.22 
 
 		 175 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2460  protein of unknown function DUF421  24.84 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  26.47 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  26.19 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  23.57 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  24.4 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  23.59 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  24.43 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  23.74 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  26.19 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1698  hypothetical protein  20.12 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03310  hypothetical protein  26.77 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1685  hypothetical protein  19.39 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.376353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>