226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0769 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  288  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  65.52 
 
 
147 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  63.45 
 
 
149 aa  195  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  63.01 
 
 
149 aa  191  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  56.55 
 
 
151 aa  176  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  62.07 
 
 
149 aa  172  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  64.83 
 
 
149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  51.72 
 
 
149 aa  164  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  50.34 
 
 
164 aa  153  8e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  50 
 
 
150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  50 
 
 
146 aa  147  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  48.28 
 
 
146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  51.72 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  47.59 
 
 
146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  48.28 
 
 
161 aa  141  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  50.34 
 
 
156 aa  140  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  46.21 
 
 
172 aa  139  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  38.19 
 
 
164 aa  107  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  36.55 
 
 
165 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  36.43 
 
 
175 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  36.81 
 
 
158 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  33.1 
 
 
235 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  35.42 
 
 
159 aa  87.8  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  30.5 
 
 
232 aa  86.7  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  31.94 
 
 
172 aa  84.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  30.5 
 
 
232 aa  84  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  33.79 
 
 
258 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  29.29 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  28.99 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  32.62 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  28.47 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  30.88 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  30 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  28.26 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1869  membrane protein-like protein  33.59 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262643  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  29.29 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  26.76 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0825  hypothetical protein  30.99 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.102228 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  27.46 
 
 
227 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  29.58 
 
 
234 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  27.14 
 
 
224 aa  73.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  29.69 
 
 
215 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  29.69 
 
 
215 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  25.85 
 
 
178 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  26.12 
 
 
177 aa  73.6  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  26.21 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  29.69 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  26.39 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  27.14 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  29.69 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  29.69 
 
 
215 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  29.69 
 
 
215 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  29.69 
 
 
215 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  25.74 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  33.33 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  27.41 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  28.91 
 
 
215 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  27.78 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  28.91 
 
 
215 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  33.33 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4346  protein of unknown function DUF421  31.08 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0250687  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  29.13 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2237  hypothetical protein  29.58 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2030  hypothetical protein  30.71 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334364  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  25 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  25.52 
 
 
248 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  26.24 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  25.87 
 
 
232 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  26.12 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1122  protein of unknown function DUF421  28.87 
 
 
242 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1704  hypothetical protein  22.39 
 
 
228 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1685  hypothetical protein  22.39 
 
 
228 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.376353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1882  hypothetical protein  22.39 
 
 
228 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.929447 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1838  hypothetical protein  22.39 
 
 
228 aa  66.6  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.315149  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  28.47 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  28.47 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  28.47 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  28.47 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  28.47 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  28.47 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  28.47 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  28.47 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  28.47 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0812  protein of unknown function DUF421  29.37 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  26.57 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0674  hypothetical protein  25 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  23.78 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  28.67 
 
 
242 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  24.65 
 
 
230 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  20.98 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  25.37 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  26.95 
 
 
202 aa  63.9  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  31.69 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  23.24 
 
 
225 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  26.87 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  26.43 
 
 
186 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  29.2 
 
 
230 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  29.2 
 
 
230 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  29.2 
 
 
230 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>