114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3116 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3116  protein of unknown function DUF421  100 
 
 		 229 aa  471  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5258  membrane protein-like protein  53.51 
 
 		 228 aa  257  8e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0625  protein of unknown function DUF421  50 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0519  protein of unknown function DUF421  48.91 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  36.96 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5259  protein of unknown function DUF421  36.8 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0626  protein of unknown function DUF421  37.72 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0141494  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0520  protein of unknown function DUF421  39.13 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  25.56 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  30.04 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  30.04 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  27.48 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  27.43 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  27.11 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  24.32 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  24.32 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  24.32 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  24.32 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  24.32 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  24.32 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  24.32 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  24.32 
 
 		 230 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  25.91 
 
 		 230 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  25.91 
 
 		 230 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  25.91 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  25.91 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  25.91 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  27.35 
 
 		 272 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  23.87 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  26.91 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  24.55 
 
 		 230 aa  89.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5467  protein of unknown function DUF421  24.31 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  26.34 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  27.37 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2486  hypothetical protein  26.97 
 
 		 163 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  28.87 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  29.53 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  27.52 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  31.41 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2188  hypothetical protein  28.68 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000216241  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  25 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  25.62 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  26 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2607  hypothetical protein  26.39 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00192347  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  24.67 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  25.16 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  23.6 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2644  hypothetical protein  26.39 
 
 		 165 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0254116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  20.56 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  23.18 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  24.63 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2763  hypothetical protein  25.74 
 
 		 165 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000337071 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2332  hypothetical protein  25.69 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  23.97 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  23.08 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4230  hypothetical protein  22.28 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000285959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  22.22 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  23.72 
 
 		 161 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3910  hypothetical protein  23.37 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0966557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  23.16 
 
 		 286 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4288  hypothetical protein  22.28 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000645093  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  22.83 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  27.46 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1799  protein of unknown function DUF421  29.25 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0271913  normal  0.21316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2563  hypothetical protein  24.26 
 
 		 165 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  25.5 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  23.56 
 
 		 164 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4268  hypothetical protein  22.28 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.929825  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  24.31 
 
 		 172 aa  52.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  22.44 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  21.53 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  24.32 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  23.53 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2639  YdfS  22.67 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0966  hypothetical protein  21.74 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000924114  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  25 
 
 		 173 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  24.83 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  24.4 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3999  hypothetical protein  21.74 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  23.33 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  24.16 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  22.58 
 
 		 286 aa  50.1  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  24.4 
 
 		 166 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22070  predicted membrane protein  26.36 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  22.45 
 
 		 149 aa  48.9  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  21.48 
 
 		 166 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2382  protein of unknown function DUF421  25.62 
 
 		 281 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.173055  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  21.56 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  23.57 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  22.15 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  22.15 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  23.23 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1712  hypothetical protein  24.67 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.144314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  21.85 
 
 		 173 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  22.45 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  22.22 
 
 		 146 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1825  protein of unknown function DUF421  20.27 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  24.52 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2460  protein of unknown function DUF421  20.69 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1334  hypothetical protein  22.36 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>