225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4754 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  283  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  67.81 
 
 		 146 aa  206  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  59.59 
 
 		 150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  55.48 
 
 		 146 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  52.41 
 
 		 149 aa  153  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  51.03 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  53.42 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  48.28 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  51.03 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  46.9 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  51.37 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  50.34 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  50.34 
 
 		 161 aa  141  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  52.41 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  47.59 
 
 		 149 aa  136  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  53.42 
 
 		 150 aa  135  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  48.63 
 
 		 156 aa  133  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  34.78 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  35.92 
 
 		 175 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  32.64 
 
 		 235 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  38.03 
 
 		 172 aa  92.8  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  31.91 
 
 		 226 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  36.36 
 
 		 234 aa  89  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  35.86 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  32.88 
 
 		 258 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  33.09 
 
 		 171 aa  86.3  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0674  hypothetical protein  31.65 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  32.39 
 
 		 173 aa  85.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  33.1 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  29.79 
 
 		 232 aa  84.7  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  31.94 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  29.08 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  25.87 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  32.17 
 
 		 232 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  31.69 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  28.37 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  34.72 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  32.41 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  29.08 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  31.51 
 
 		 248 aa  78.2  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  32.41 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  32.87 
 
 		 202 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  33.1 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  25.87 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  28.47 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  28.37 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  28.06 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1026  hypothetical protein  38.41 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.170093  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  34.48 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  35.71 
 
 		 170 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  24.11 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  28.77 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  29.66 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  25.58 
 
 		 215 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  25.58 
 
 		 215 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  26.98 
 
 		 218 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  32.14 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1869  membrane protein-like protein  33.07 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262643  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  25.58 
 
 		 215 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  25.58 
 
 		 215 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  25.58 
 
 		 215 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  25.58 
 
 		 215 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  28.97 
 
 		 188 aa  70.5  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  25.58 
 
 		 215 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  25.58 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4346  protein of unknown function DUF421  32.37 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0250687  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1704  hypothetical protein  22.14 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1685  hypothetical protein  22.14 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.376353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1882  hypothetical protein  22.14 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.929447 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1838  hypothetical protein  22.14 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.315149  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  26.43 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1712  hypothetical protein  26.62 
 
 		 227 aa  67  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.144314  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0812  protein of unknown function DUF421  32.87 
 
 		 173 aa  67  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1799  protein of unknown function DUF421  26.32 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0271913  normal  0.21316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  29.5 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2460  protein of unknown function DUF421  27.14 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  29.25 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  25.87 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2030  hypothetical protein  25.9 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334364  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  22.3 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  25.87 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  23.78 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  27.78 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1825  protein of unknown function DUF421  27.14 
 
 		 225 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  29.1 
 
 		 185 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2237  hypothetical protein  25.87 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  29.86 
 
 		 226 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  27.21 
 
 		 237 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  27.59 
 
 		 178 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1698  hypothetical protein  22.14 
 
 		 228 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0825  hypothetical protein  28.97 
 
 		 205 aa  63.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.102228 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  27.08 
 
 		 173 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  32.88 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3499  hypothetical protein  22.86 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.664218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  28.26 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  28.26 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03310  hypothetical protein  31.78 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  25.69 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1334  hypothetical protein  30.43 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>