198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1650 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  310  3.9999999999999997e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  55.7 
 
 
164 aa  164  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  52.35 
 
 
151 aa  159  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  49.66 
 
 
149 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  53.38 
 
 
150 aa  151  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  151  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  48.97 
 
 
172 aa  148  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  50.34 
 
 
147 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  48.97 
 
 
149 aa  145  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  50.34 
 
 
161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  48.63 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  46.9 
 
 
147 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  48.28 
 
 
149 aa  138  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  45.89 
 
 
146 aa  137  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  51.02 
 
 
149 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  43.62 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  44.22 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  37.09 
 
 
175 aa  97.4  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  31.91 
 
 
168 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  29.52 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  34.42 
 
 
202 aa  84  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  32.64 
 
 
172 aa  80.9  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  32.35 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  30.26 
 
 
167 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  30.34 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  34.01 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0674  hypothetical protein  27.86 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1026  hypothetical protein  40.27 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.170093  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  28.97 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  34.72 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  29.93 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  25.5 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  27.5 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  28.48 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  28.28 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0825  hypothetical protein  33.1 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.102228 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1869  membrane protein-like protein  38.28 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262643  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  30.56 
 
 
172 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  27.81 
 
 
227 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0812  protein of unknown function DUF421  35.37 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  27.4 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  26.62 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  24.5 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  26.97 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  29.86 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  30.32 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  25.69 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  28.1 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1698  hypothetical protein  26.57 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  25.33 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1961  hypothetical protein  25.87 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1660  hypothetical protein  25.87 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  27.78 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1844  hypothetical protein  25.87 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  30.71 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1704  hypothetical protein  25.87 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1685  hypothetical protein  25.87 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.376353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1838  hypothetical protein  25.87 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.315149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  26.49 
 
 
241 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  27.08 
 
 
232 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1882  hypothetical protein  25.87 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.929447 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1926  hypothetical protein  24.48 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328835  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  27.21 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  26.39 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  28.08 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  26.76 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3499  hypothetical protein  24.48 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.664218  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21740  predicted membrane protein  29.38 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.963565  normal  0.777873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  24.68 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  27.4 
 
 
289 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  27.4 
 
 
289 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  26.09 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1712  hypothetical protein  26.21 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.144314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  29.29 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  29.45 
 
 
196 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  26.49 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  26.62 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  27.4 
 
 
289 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  26.62 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  26.62 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  27.78 
 
 
289 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  25.34 
 
 
289 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  27.78 
 
 
289 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  33.79 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  27.78 
 
 
289 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  27.08 
 
 
289 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  28.29 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  26.62 
 
 
215 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  25.18 
 
 
215 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  27.4 
 
 
289 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  25.9 
 
 
215 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  25.34 
 
 
289 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  25.18 
 
 
215 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  25.9 
 
 
215 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  28.29 
 
 
175 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5253  hypothetical protein  27.08 
 
 
289 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  26.71 
 
 
289 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  24.66 
 
 
171 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  25 
 
 
232 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  27.86 
 
 
188 aa  62.4  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>