179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3820 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  340  4e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  56.98 
 
 		 173 aa  184  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  59.74 
 
 		 226 aa  177  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  50.96 
 
 		 188 aa  164  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  55.84 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  58.33 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  51.59 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  50.29 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  44.38 
 
 		 184 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  148  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  148  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  43.42 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4346  protein of unknown function DUF421  48.43 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0250687  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  45.96 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  38.82 
 
 		 185 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3836  hypothetical protein  57.69 
 
 		 121 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147989  normal  0.0810838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2271  hypothetical protein  39.62 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  32.08 
 
 		 180 aa  97.8  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  31.85 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  32.05 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  28.95 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  33.1 
 
 		 151 aa  80.5  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  30.37 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  29.08 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  26.14 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  30.5 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  30.77 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  30.52 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  28.77 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  28.08 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  27.7 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  25.9 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  32.82 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  27.92 
 
 		 245 aa  72  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  25 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  28.47 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03310  hypothetical protein  33.77 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  28.47 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  27.01 
 
 		 215 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  30.87 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  27.74 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  27.74 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  27.74 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  27.74 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  24.1 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  30.43 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  27.69 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  26.12 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  26.97 
 
 		 286 aa  67.8  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06995  hypothetical protein  27.22 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294218  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  27.33 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  29.45 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  25.66 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  25.9 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  28 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  26.87 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  24.64 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  25.17 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  26.81 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  25.9 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  21.33 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  27.44 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1825  protein of unknown function DUF421  25 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  27.82 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  26.12 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1968  protein of unknown function DUF421  28.21 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  27.91 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  25.6 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  29.5 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  26.83 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  26.53 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  21.77 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5259  protein of unknown function DUF421  28.21 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  25.83 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  27.86 
 
 		 146 aa  62  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  26.14 
 
 		 155 aa  62  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2639  YdfS  23.49 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  25.64 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  24.55 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  24.29 
 
 		 241 aa  60.8  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  22.5 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  22.88 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  24.66 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  26.42 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  26.19 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  28.06 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  26.53 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  23.13 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  21.57 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  27.82 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  26.24 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2237  hypothetical protein  24.84 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  27.82 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  22.63 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  24.57 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  22.3 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  24.67 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  20.26 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>