190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4346 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4346  protein of unknown function DUF421  100 
 
 
174 aa  332  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0250687  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  56.55 
 
 
175 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  56.55 
 
 
175 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  56.44 
 
 
175 aa  175  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  51.46 
 
 
173 aa  153  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  53.66 
 
 
166 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  52.29 
 
 
165 aa  150  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  51.33 
 
 
226 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  49.07 
 
 
166 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  55.13 
 
 
160 aa  138  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  48.43 
 
 
171 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  44.97 
 
 
188 aa  136  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  43.42 
 
 
177 aa  129  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  41.51 
 
 
184 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  40.83 
 
 
185 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  35.62 
 
 
180 aa  119  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  32.08 
 
 
179 aa  111  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3836  hypothetical protein  57.55 
 
 
121 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147989  normal  0.0810838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2271  hypothetical protein  38.12 
 
 
170 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  36.42 
 
 
170 aa  95.9  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  31.65 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  27.74 
 
 
227 aa  79  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  36.55 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  28.9 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  33.56 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  32.65 
 
 
151 aa  77.4  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  32.37 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  27.34 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  29.71 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  29.17 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  32.39 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  25.19 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  31.29 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  28.78 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  27.86 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  26.76 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  26.43 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  27.27 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  27.27 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  30.14 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  27.81 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03310  hypothetical protein  34.81 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  25.71 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  30.15 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  26.52 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  26.52 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  26.52 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  24.82 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  29.32 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1026  hypothetical protein  35 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.170093  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  24.83 
 
 
242 aa  68.2  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  27.07 
 
 
289 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  26.52 
 
 
215 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0812  protein of unknown function DUF421  33.1 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  26.52 
 
 
215 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  25.95 
 
 
243 aa  67.8  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  27.69 
 
 
286 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  26.32 
 
 
164 aa  67  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  27.74 
 
 
172 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  21.74 
 
 
232 aa  67  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  26.15 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  25.19 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2639  YdfS  25.6 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  25.19 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  25.19 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  23.19 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  24.52 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  28.47 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  25.19 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  25.19 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  25.19 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  25.19 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  25.19 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  28.97 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  27.86 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  24.81 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  21.79 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  24.64 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  29.25 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  25.38 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  28.87 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  29.93 
 
 
242 aa  64.3  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  29.93 
 
 
234 aa  63.9  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  28.47 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  29.66 
 
 
149 aa  63.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  30.94 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  23.94 
 
 
253 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  21.01 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0825  hypothetical protein  32.84 
 
 
205 aa  62.8  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.102228 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1968  protein of unknown function DUF421  26.17 
 
 
245 aa  62.4  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  26.19 
 
 
218 aa  62.4  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06995  hypothetical protein  26.57 
 
 
174 aa  62  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1799  protein of unknown function DUF421  25.37 
 
 
224 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0271913  normal  0.21316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  22.93 
 
 
289 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  26.32 
 
 
232 aa  61.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  32.88 
 
 
158 aa  61.2  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  30 
 
 
159 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  27.94 
 
 
232 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  22.29 
 
 
289 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0719  hypothetical protein  24.53 
 
 
230 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.772033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>