214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3352 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  100 
 
 
173 aa  332  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  65.36 
 
 
165 aa  195  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  63.06 
 
 
226 aa  194  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  56.4 
 
 
188 aa  185  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  56.98 
 
 
171 aa  184  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  67.11 
 
 
160 aa  176  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0399  protein of unknown function DUF421  52.41 
 
 
166 aa  155  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  41.76 
 
 
185 aa  154  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  50.98 
 
 
177 aa  153  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  50.93 
 
 
175 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  50.93 
 
 
175 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  50.93 
 
 
175 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4346  protein of unknown function DUF421  51.46 
 
 
174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0250687  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  44.03 
 
 
184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  50.71 
 
 
166 aa  140  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3836  hypothetical protein  67.31 
 
 
121 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147989  normal  0.0810838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  43.29 
 
 
170 aa  132  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  35.8 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  35.44 
 
 
180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2271  hypothetical protein  38.16 
 
 
170 aa  105  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  37.12 
 
 
172 aa  88.2  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  30.5 
 
 
168 aa  87  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  30.77 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  31.69 
 
 
227 aa  85.9  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2201  membrane protein-like protein  35.25 
 
 
186 aa  84.7  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  28.1 
 
 
215 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  30.99 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  26.67 
 
 
224 aa  82  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  28.68 
 
 
243 aa  80.9  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  29.37 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  29.23 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  27.95 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0914  hypothetical protein  32.65 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  29.23 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  30.22 
 
 
149 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  26.57 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  28.46 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  28.46 
 
 
215 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  28.46 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  27.41 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  28.46 
 
 
215 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  30.52 
 
 
245 aa  77.4  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  28.46 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  30 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  33.95 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  30.16 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  25.81 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  30.22 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03310  hypothetical protein  35.71 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  27.27 
 
 
232 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  29.5 
 
 
286 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  27.27 
 
 
225 aa  74.3  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0220  hypothetical protein  31.21 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  73.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  25.35 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  30.46 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  26.57 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  31.54 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  27.66 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  30.88 
 
 
173 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  26.87 
 
 
173 aa  72  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  28.36 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  29.77 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  27.03 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  27.34 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  23.65 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1122  protein of unknown function DUF421  28.38 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  27.14 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  28.89 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  30.16 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  28.03 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  24.36 
 
 
232 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  26.21 
 
 
258 aa  68.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  26.8 
 
 
229 aa  67.8  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  28.57 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  29.86 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  26.32 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1968  protein of unknown function DUF421  29.93 
 
 
245 aa  67  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  27.21 
 
 
147 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  24.36 
 
 
232 aa  67  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  27.27 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  28.57 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  25.85 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  30.5 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  28.93 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  29.5 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  29.25 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  29.56 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  28.79 
 
 
289 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  30.08 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  26.52 
 
 
289 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  26.52 
 
 
289 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  26.52 
 
 
289 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  27.4 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  26.52 
 
 
289 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  26.52 
 
 
289 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  26.52 
 
 
289 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  24.2 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  26.47 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  27.1 
 
 
242 aa  64.7  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>