223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3940 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  313  6e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  45.33 
 
 
175 aa  154  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  45.45 
 
 
165 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  46.67 
 
 
158 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  45.45 
 
 
167 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  47.4 
 
 
155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  120  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  120  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  36.88 
 
 
168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  39.04 
 
 
173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  34.9 
 
 
172 aa  108  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0812  protein of unknown function DUF421  47.86 
 
 
173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  35.17 
 
 
172 aa  107  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  43.59 
 
 
170 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  35.42 
 
 
147 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0825  hypothetical protein  42.31 
 
 
205 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.102228 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  32.89 
 
 
171 aa  104  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  34.39 
 
 
178 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  33.8 
 
 
164 aa  103  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  37.32 
 
 
147 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  38.41 
 
 
149 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  33.33 
 
 
164 aa  97.4  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1026  hypothetical protein  47.18 
 
 
172 aa  97.4  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.170093  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  37.24 
 
 
149 aa  97.4  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  35.57 
 
 
165 aa  95.5  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  31.76 
 
 
177 aa  94.4  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  33.78 
 
 
149 aa  94.4  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  32.19 
 
 
150 aa  94  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  34.72 
 
 
151 aa  93.6  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  35.19 
 
 
188 aa  93.6  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  32.19 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  36.36 
 
 
146 aa  93.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  30 
 
 
242 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  32.17 
 
 
146 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  36.62 
 
 
161 aa  92  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  32.48 
 
 
160 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  32.19 
 
 
166 aa  91.3  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  36.73 
 
 
164 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  32.41 
 
 
227 aa  89.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  30.82 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  34.48 
 
 
146 aa  88.6  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  34.44 
 
 
202 aa  87.8  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  29.2 
 
 
173 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  32.17 
 
 
226 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  37.98 
 
 
149 aa  87  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6233  hypothetical protein  35.92 
 
 
160 aa  87  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303175  normal  0.107487 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  28.48 
 
 
215 aa  87  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  32.14 
 
 
185 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  33.55 
 
 
165 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  32.45 
 
 
171 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  34.97 
 
 
149 aa  86.3  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4894  hypothetical protein  37.41 
 
 
163 aa  85.5  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  34.72 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  30.34 
 
 
179 aa  85.5  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3817  hypothetical protein  37.41 
 
 
163 aa  85.5  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1869  membrane protein-like protein  34.76 
 
 
199 aa  85.5  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262643  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  28.37 
 
 
228 aa  84.3  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  31.13 
 
 
196 aa  84.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  32.47 
 
 
166 aa  84  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  34.39 
 
 
175 aa  84  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  35.17 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  28.67 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  33.76 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  25.87 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  26.57 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2237  hypothetical protein  28.39 
 
 
163 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  27.97 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  30.46 
 
 
184 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  31.25 
 
 
243 aa  80.5  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  26.24 
 
 
224 aa  80.5  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  33.78 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  32.62 
 
 
230 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  32.62 
 
 
230 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  31.85 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  32.62 
 
 
230 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  32.62 
 
 
230 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  32.62 
 
 
230 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  32.62 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  32.62 
 
 
230 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  32.62 
 
 
230 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  32.19 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  32.62 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2115  hypothetical membrane associated protein  33.57 
 
 
199 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0071  hypothetical protein  33.57 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  25.17 
 
 
232 aa  79  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  25.87 
 
 
232 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  28.67 
 
 
215 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  28.67 
 
 
215 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  25.68 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  32.62 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  32.62 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  32.62 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  32.62 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  28.87 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2990  hypothetical protein  33.85 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138787  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  24.65 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  29.79 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  28.77 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  26.57 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>