221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_11070 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  100 
 
 
149 aa  285  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  80 
 
 
149 aa  227  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  80 
 
 
149 aa  204  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  63.01 
 
 
147 aa  191  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  62.07 
 
 
147 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  58.62 
 
 
151 aa  176  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  57.82 
 
 
149 aa  164  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  50 
 
 
149 aa  154  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  49.66 
 
 
164 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  55.86 
 
 
150 aa  149  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  53.1 
 
 
161 aa  147  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  48.97 
 
 
172 aa  147  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  48.61 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  47.59 
 
 
146 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  47.92 
 
 
146 aa  137  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  48.97 
 
 
156 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  47.59 
 
 
146 aa  136  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  35.57 
 
 
165 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  33.57 
 
 
175 aa  90.1  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  31.25 
 
 
164 aa  87  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  35.46 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  34.75 
 
 
165 aa  84  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  37.24 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  30.43 
 
 
215 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  34.03 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  32.14 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  30.82 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  32.58 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  32.58 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  30.77 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  30.28 
 
 
230 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  30.28 
 
 
230 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  30.28 
 
 
230 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  30.28 
 
 
230 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  30.28 
 
 
230 aa  77.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  29.79 
 
 
224 aa  77.4  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  28.87 
 
 
235 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  27.46 
 
 
242 aa  77.4  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  31.82 
 
 
215 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  31.82 
 
 
215 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  31.82 
 
 
215 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0825  hypothetical protein  33.8 
 
 
205 aa  77  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.102228 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  25 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  28.77 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  28.87 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  28.87 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  28.87 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  28.87 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  28.87 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  28.87 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  28.87 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  32.54 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  28.87 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  28.87 
 
 
230 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  28.97 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  31.75 
 
 
215 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0674  hypothetical protein  28.57 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  30.3 
 
 
215 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  30.3 
 
 
215 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  31.25 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  28.36 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  23.24 
 
 
226 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  27.01 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  28.87 
 
 
234 aa  70.1  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  27.94 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  21.92 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  26.71 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  28.06 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  26.85 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  24.66 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  26.47 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  27.86 
 
 
241 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4224  hypothetical protein  27.08 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  26.71 
 
 
227 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  26.03 
 
 
230 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  25.52 
 
 
230 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  26.9 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1026  hypothetical protein  36.17 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.170093  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  24.64 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  28.47 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  35.17 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  31.51 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  22.96 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  28.37 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1869  membrane protein-like protein  29.46 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262643  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  27.14 
 
 
175 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  24.44 
 
 
166 aa  63.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  24.16 
 
 
179 aa  63.5  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  24.83 
 
 
248 aa  63.5  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  24.29 
 
 
227 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  26.39 
 
 
172 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  26.03 
 
 
232 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  28.15 
 
 
272 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3817  hypothetical protein  28.47 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  26.24 
 
 
232 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  26.95 
 
 
232 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  28.15 
 
 
272 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4894  hypothetical protein  28.47 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  25.53 
 
 
228 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  25.5 
 
 
172 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>