221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2764 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  343  6e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  50.34 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  47.59 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  52.41 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  48.28 
 
 		 161 aa  148  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  49.66 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  48.97 
 
 		 149 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  46.9 
 
 		 146 aa  145  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3287  hypothetical protein  47.65 
 
 		 149 aa  144  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.581053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  46.21 
 
 		 149 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  45.58 
 
 		 147 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  48.97 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  46.21 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  44.83 
 
 		 164 aa  137  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  45.31 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  40.28 
 
 		 150 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  39.58 
 
 		 146 aa  121  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  39.16 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  35.26 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  40.14 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  34.31 
 
 		 171 aa  101  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  35.42 
 
 		 227 aa  96.3  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  34.9 
 
 		 172 aa  94.4  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  30.81 
 
 		 173 aa  94  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  34.29 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  34.72 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  35.17 
 
 		 159 aa  90.9  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  33.1 
 
 		 235 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  33.8 
 
 		 155 aa  88.6  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  30 
 
 		 172 aa  88.2  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  33.1 
 
 		 155 aa  87.8  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  28.57 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0674  hypothetical protein  30 
 
 		 143 aa  86.3  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0812  protein of unknown function DUF421  36.36 
 
 		 173 aa  85.5  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1869  membrane protein-like protein  37.04 
 
 		 199 aa  85.5  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  31.97 
 
 		 164 aa  84.3  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  28.67 
 
 		 232 aa  84.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  29.33 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  33.1 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  29.93 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  38.19 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  31.43 
 
 		 241 aa  81.3  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  27.08 
 
 		 242 aa  81.3  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  34.72 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  32.64 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  30.28 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  27.63 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  26.76 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  34.13 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  30.77 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  29.61 
 
 		 227 aa  77.8  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  28.66 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  27.13 
 
 		 230 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  27.08 
 
 		 232 aa  77.8  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1026  hypothetical protein  37.33 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.170093  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  26.43 
 
 		 224 aa  77.4  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  27.13 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1012  protein of unknown function DUF421  32.28 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0825  hypothetical protein  31.18 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.102228 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  32.64 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  27.66 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1704  hypothetical protein  26.57 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1882  hypothetical protein  26.57 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.929447 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1685  hypothetical protein  26.57 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.376353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1838  hypothetical protein  26.57 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.315149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  28.37 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  31.75 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  31.75 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  30 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  25.9 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  30.16 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  30.16 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  30.16 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  30.16 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  29.37 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  28.47 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  29.37 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2237  hypothetical protein  26.53 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11408  hypothetical protein  25.32 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0751825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  29.17 
 
 		 286 aa  71.2  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2218  hypothetical protein  27.03 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.450386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  26.95 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  27.78 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  22.97 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1698  hypothetical protein  24.48 
 
 		 228 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3499  hypothetical protein  23.78 
 
 		 228 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.664218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  28.47 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  26.06 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  23.65 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  26.06 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  27.34 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  26.06 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  26.06 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  26.06 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1712  hypothetical protein  27.08 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.144314  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1926  hypothetical protein  23.78 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.328835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  27.21 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>