173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1251 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  100 
 
 
175 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  98.86 
 
 
175 aa  353  5e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  87.26 
 
 
175 aa  290  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  50.6 
 
 
178 aa  183  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  50 
 
 
165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  50.96 
 
 
166 aa  162  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  46.25 
 
 
172 aa  160  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  44.63 
 
 
202 aa  158  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0674  hypothetical protein  41.43 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  35.06 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2409  protein of unknown function DUF421  37.34 
 
 
172 aa  88.2  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000149876  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  29.88 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  32.21 
 
 
175 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21740  predicted membrane protein  37.09 
 
 
167 aa  82  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.963565  normal  0.777873 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  30.97 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  32.89 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  27.65 
 
 
230 aa  77.4  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  31.91 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  30.07 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  29.75 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  32.85 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  29.68 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  29.94 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  30.25 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  25.95 
 
 
173 aa  72  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  29.8 
 
 
188 aa  72  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  27.78 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  34.39 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  26 
 
 
286 aa  67.8  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  31.41 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  28 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  27.81 
 
 
227 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  32.88 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  28.93 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  26 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  26.63 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  29.05 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  31.69 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3820  hypothetical protein  27.44 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  27.86 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  24.05 
 
 
227 aa  63.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  25.48 
 
 
227 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  25.17 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  24.52 
 
 
211 aa  62.8  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  26.03 
 
 
215 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  25.81 
 
 
230 aa  60.8  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  25 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0551  membrane protein-like protein  23.53 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000937148 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  26.42 
 
 
242 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  29.33 
 
 
230 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  29.33 
 
 
230 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  27.08 
 
 
228 aa  59.7  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  27.33 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  29.33 
 
 
230 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  29.33 
 
 
230 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  29.33 
 
 
230 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  25.93 
 
 
185 aa  58.9  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  25.79 
 
 
230 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  26.92 
 
 
272 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  26.92 
 
 
272 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  26.43 
 
 
147 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  25.16 
 
 
230 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  25.16 
 
 
230 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  25.16 
 
 
230 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1650  hypothetical protein  28.29 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0747624  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  25.16 
 
 
230 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  25.16 
 
 
230 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  25.16 
 
 
230 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  25.16 
 
 
230 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  25.16 
 
 
230 aa  58.5  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  25 
 
 
151 aa  58.2  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  25.32 
 
 
225 aa  58.2  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  25.69 
 
 
149 aa  57.8  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  23.38 
 
 
226 aa  57.8  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  29.22 
 
 
230 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2641  hypothetical protein  27.7 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.865763  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  26.49 
 
 
234 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  25.17 
 
 
258 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2686  hypothetical protein  27.7 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  0.0102559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2670  hypothetical protein  28.29 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  23.08 
 
 
289 aa  57  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1968  protein of unknown function DUF421  26.95 
 
 
245 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  24 
 
 
286 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  23.26 
 
 
232 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  27.08 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4754  hypothetical protein  25.69 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204724  normal  0.0118925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0519  protein of unknown function DUF421  25.9 
 
 
228 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  25.85 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  23.08 
 
 
289 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  23.08 
 
 
289 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1869  membrane protein-like protein  28.3 
 
 
199 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262643  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  22 
 
 
184 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0625  protein of unknown function DUF421  27.5 
 
 
226 aa  55.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  28.57 
 
 
230 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  23.08 
 
 
289 aa  55.1  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  26 
 
 
150 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  20.81 
 
 
229 aa  55.1  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4230  hypothetical protein  28.66 
 
 
234 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000285959  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  28.35 
 
 
215 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  24.84 
 
 
224 aa  54.7  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>