228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1012 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00910  conserved inner membrane protein  100 
 
 
230 aa  473  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2737  protein of unknown function DUF421  100 
 
 
230 aa  473  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0253622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00917  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  473  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2422  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  473  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000473983  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1012  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  473  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212287  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1003  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  473  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0243553  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2690  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  473  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.355377  normal  0.77182 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1067  hypothetical protein  99.57 
 
 
230 aa  471  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0942748  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2215  hypothetical protein  99.57 
 
 
230 aa  471  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.297842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1009  hypothetical protein  86.09 
 
 
230 aa  410  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1074  hypothetical protein  86.09 
 
 
230 aa  410  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.325553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0981  hypothetical protein  85.65 
 
 
230 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00314697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1040  hypothetical protein  85.65 
 
 
230 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1089  hypothetical protein  85.22 
 
 
230 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1426  hypothetical protein  80.87 
 
 
230 aa  401  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320436  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2726  hypothetical protein  44.84 
 
 
230 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3028  membrane protein-like protein  44.39 
 
 
230 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  42.73 
 
 
230 aa  198  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  38.84 
 
 
230 aa  181  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  41.28 
 
 
232 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  41.2 
 
 
227 aa  168  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5467  protein of unknown function DUF421  42.21 
 
 
225 aa  166  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  30.7 
 
 
272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  30.7 
 
 
272 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2486  hypothetical protein  34.76 
 
 
163 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  33.12 
 
 
188 aa  98.6  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  26.91 
 
 
229 aa  98.2  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5259  protein of unknown function DUF421  26.7 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3116  protein of unknown function DUF421  24.32 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5258  membrane protein-like protein  25.23 
 
 
228 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0519  protein of unknown function DUF421  27.19 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3273  protein of unknown function DUF421  32.37 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0626  protein of unknown function DUF421  21.62 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0141494  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  29.94 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  26.43 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11070  conserved hypothetical membrane-anchored protein  28.87 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  26.03 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  28.06 
 
 
149 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  32.12 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1469  hypothetical protein  26.67 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  28.28 
 
 
175 aa  72  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36940  hypothetical protein  31.2 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309583  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0625  protein of unknown function DUF421  23.58 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0520  protein of unknown function DUF421  24.32 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  29.3 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  28.95 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  27.33 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0127  hypothetical protein  28.86 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  27.56 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  24.65 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1555  hypothetical protein  27.54 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2332  hypothetical protein  26.8 
 
 
165 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2563  hypothetical protein  26.38 
 
 
165 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2644  hypothetical protein  26 
 
 
165 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0254116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  27.89 
 
 
289 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5311  hypothetical protein  27.89 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  27.89 
 
 
289 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1348  hypothetical protein  28.26 
 
 
232 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0566  hypothetical protein  21.43 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  27.66 
 
 
173 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  28.28 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  28.28 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2189  hypothetical protein  29.53 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000145811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  27.89 
 
 
289 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0408  hypothetical protein  29.29 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  28.28 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2763  hypothetical protein  25.77 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000337071 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2406  hypothetical protein  28.35 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.285928  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  25.9 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0436  hypothetical protein  26.28 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1938  protein of unknown function DUF421  30.91 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2671  protein of unknown function DUF421  30 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  28.47 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2607  hypothetical protein  25.33 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00192347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2187  hypothetical protein  27.89 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000023722  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5269  hypothetical protein  27.21 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1466  hypothetical protein  25.85 
 
 
286 aa  65.1  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5253  hypothetical protein  27.59 
 
 
289 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  32.62 
 
 
159 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0231  hypothetical protein  27.59 
 
 
289 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.723048  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0204  hypothetical protein  27.21 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0434  hypothetical protein  21.85 
 
 
179 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  26.32 
 
 
167 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  23.57 
 
 
227 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  25.53 
 
 
286 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3692  hypothetical protein  26.9 
 
 
289 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5498  hypothetical protein  27.46 
 
 
173 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  25.68 
 
 
171 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  21.77 
 
 
185 aa  63.2  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4943  hypothetical protein  26.9 
 
 
289 aa  63.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  23.42 
 
 
226 aa  62.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  29.45 
 
 
167 aa  62.4  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0966  hypothetical protein  24.22 
 
 
234 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000924114  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3133  hypothetical protein  22.97 
 
 
149 aa  62  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.152895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4268  hypothetical protein  24.53 
 
 
234 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.929825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4230  hypothetical protein  24.53 
 
 
234 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000285959  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0711  protein of unknown function DUF421  24.11 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  27.27 
 
 
151 aa  61.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1658  protein of unknown function DUF421  25.53 
 
 
286 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  26.24 
 
 
172 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>