175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2415 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2415  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.696624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2566  hypothetical protein  98.11 
 
 		 165 aa  311  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.31826  hitchhiker  0.0000735154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0947  protein of unknown function DUF421  51.76 
 
 		 178 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528971  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3409  hypothetical protein  47.77 
 
 		 172 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00991237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0523  protein of unknown function DUF421  51.59 
 
 		 175 aa  164  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1251  protein of unknown function DUF421  50.96 
 
 		 175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1108  hypothetical protein  50.32 
 
 		 175 aa  160  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2146  hypothetical protein  43.9 
 
 		 202 aa  151  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.573525  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0674  hypothetical protein  39.57 
 
 		 143 aa  123  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21740  predicted membrane protein  39.87 
 
 		 167 aa  100  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.963565  normal  0.777873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5983  hypothetical protein  34.42 
 
 		 165 aa  94  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2409  protein of unknown function DUF421  43.04 
 
 		 172 aa  94  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000149876  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4363  hypothetical protein  33.99 
 
 		 167 aa  91.3  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2827  hypothetical protein  30.63 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2247  protein of unknown function DUF421  30.5 
 
 		 168 aa  88.6  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3332  hypothetical protein  32.9 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4082  protein of unknown function DUF421  30.67 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3992  hypothetical protein  32.68 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3224  protein of unknown function DUF421  30.56 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826771  normal  0.0304981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4212  protein of unknown function DUF421  32.39 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.983168 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3383  hypothetical protein  29.87 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1415  hypothetical protein  27.61 
 
 		 227 aa  77.4  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.228022 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0919  hypothetical protein  31.41 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1130  hypothetical protein  31.37 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2791  hypothetical protein  31.37 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0198  protein of unknown function DUF421  30.07 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2581  membrane protein-like protein  28.77 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604139  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0854  hypothetical protein  31.17 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1589  hypothetical protein  31.11 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2194  protein of unknown function DUF421  25 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1504  hypothetical protein  27.1 
 
 		 177 aa  72  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3005  hypothetical protein  29.86 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3563  hypothetical protein  32.47 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2636  protein of unknown function DUF421  28.47 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.753675  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2343  protein of unknown function DUF421  34.48 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0702  hypothetical protein  26.67 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00491681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3232  protein of unknown function DUF421  27.78 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3940  hypothetical protein  32.47 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05340  predicted membrane protein  26 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00296282  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1106  membrane protein-like protein  29.41 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00481139  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12630  predicted membrane protein  27.89 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2202  hypothetical protein  29.93 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2827  membrane protein-like protein  30.82 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1968  protein of unknown function DUF421  28.3 
 
 		 245 aa  67  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0071  hypothetical protein  26.97 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3051  protein of unknown function DUF421  28.57 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1485  protein of unknown function DUF421  32.67 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1313  protein of unknown function DUF421  28.57 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02060  predicted membrane protein  27.78 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2084  protein of unknown function DUF421  25.66 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.138808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2138  hypothetical protein  25.5 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2115  hypothetical membrane associated protein  26.97 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2764  hypothetical protein  25 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0112  hypothetical protein  26.21 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0321  protein of unknown function DUF421  26.97 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.78667 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3175  hypothetical protein  24 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.979599  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3352  protein of unknown function DUF421  27.74 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06995  hypothetical protein  30.19 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294218  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0707  hypothetical protein  27.89 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159977  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4499  hypothetical protein  27.07 
 
 		 215 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00871532  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2617  hypothetical protein  23.12 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4548  hypothetical protein  27.07 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00119776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5258  membrane protein-like protein  26.19 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3285  membrane protein-like protein  29.41 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22155  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0051  hypothetical protein  25.31 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4147  hypothetical protein  26.32 
 
 		 215 aa  60.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000615268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4494  hypothetical protein  26.32 
 
 		 215 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000327358 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0321  hypothetical protein  25.33 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.911962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4533  hypothetical protein  25.56 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0230316  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6410  membrane protein-like protein  31.03 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3115  protein of unknown function DUF421  23.78 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05430  predicted membrane protein  32.38 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.054004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4309  hypothetical protein  25.56 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4158  hypothetical protein  25.56 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0166527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4644  hypothetical protein  25.56 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101491  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2154  hypothetical protein  25.69 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0961076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0719  protein of unknown function DUF421  25.52 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0626  protein of unknown function DUF421  28.31 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0141494  normal  0.718153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1869  membrane protein-like protein  30.13 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6439  conserved hypothetical membrane-anchored protein  26.62 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0053  hypothetical protein  24.07 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1459  hypothetical protein  26.71 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.902977  normal  0.138264 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3510  hypothetical protein  29.33 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2090  hypothetical protein  27.04 
 
 		 245 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2513  hypothetical protein  23.13 
 
 		 235 aa  57.8  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4261  hypothetical protein  28 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00116962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0769  hypothetical protein  24.31 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4843  hypothetical protein  26.03 
 
 		 289 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5688  hypothetical protein  26.03 
 
 		 289 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0625  protein of unknown function DUF421  27.85 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00740952  normal  0.965778 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0812  protein of unknown function DUF421  34.53 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3177  hypothetical protein  27.89 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3305  protein of unknown function DUF421  26.28 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00266927  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4999  hypothetical protein  26.03 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4828  hypothetical protein  26.03 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5379  hypothetical protein  26.03 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5235  hypothetical protein  26.03 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0792  protein of unknown function DUF421  24.83 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2562  hypothetical protein  24.03 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6863  protein of unknown function DUF421  23.97 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>